11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5543 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5543  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4778  hypothetical protein  30.29 
 
 		 2378 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.741162 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01330  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02700  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1938  putative integral membrane protein  28.05 
 
 		 720 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0809155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3010  putative integral membrane protein  28.34 
 
 		 727 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.339663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5681  hypothetical protein  26.81 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4956  putative integral membrane protein  30.37 
 
 		 702 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01855  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43665  predicted protein  30.77 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46908  predicted protein  26.3 
 
 		 708 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>