12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5318 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5318  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2391  lipoprotein  50.65 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  0.755106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5111  lipoprotein  45.57 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.472196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4360  hypothetical protein  40.85 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03172  putative signal peptide protein  30.45 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.203589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2685  hypothetical protein  37.5 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  0.122648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6719  hypothetical protein  22.55 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.759063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02335  hypothetical protein  25.7 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1343  putative secreted protein  30.25 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00928694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4172  hypothetical protein  29 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  29 
 
 		 582 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4492  hypothetical protein  26.8 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>