30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5270 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5270  Sucraseferredoxin family protein  100 
 
 
314 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13820  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  40.33 
 
 
323 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8095  Sucraseferredoxin family protein  43.95 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4377  sucraseferredoxin family protein  42.61 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0587956  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2240  sucraseferredoxin family protein  36.27 
 
 
301 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3280  Sucraseferredoxin family protein  39.08 
 
 
313 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6685  hypothetical protein  36.26 
 
 
312 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3065  Sucraseferredoxin family protein  40.09 
 
 
308 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185478  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1795  Sucraseferredoxin family protein  37.67 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1340  Sucraseferredoxin family protein  42.48 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421578  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02490  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  36.47 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0338  sucraseferredoxin family protein  34 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5631  sucraseferredoxin family protein  38.46 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4380  sucraseferredoxin family protein  38.34 
 
 
284 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5340  sucraseferredoxin family protein  38 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.901473  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5251  sucraseferredoxin-like protein  38 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1766  Sucraseferredoxin family protein  33.11 
 
 
334 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2908  Sucraseferredoxin family protein  35.74 
 
 
294 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0955  Sucraseferredoxin family protein  38.74 
 
 
313 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.886609  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5760  Sucraseferredoxin family protein  26.47 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3033  sucraseferredoxin-like  27 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.262955  hitchhiker  0.00219158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1568  sucraseferredoxin family protein  24.88 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4698  sucraseferredoxin family protein  29.86 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4480  sucraseferredoxin family protein  22.94 
 
 
269 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1040  sucraseferredoxin-like protein  31.91 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2755  sucraseferredoxin-like  43.18 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4340  hypothetical protein  23.88 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2831  hypothetical protein  25.26 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.359849 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06527  sucrase/ferredoxin-like family protein Fmi1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04900)  25.66 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
445 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>