12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4496 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4496  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8785  hypothetical protein  43.97 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1381  hypothetical protein  41.74 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.294296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2014  hypothetical protein  43.91 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00715449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0776  hypothetical protein  41.91 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2613  hypothetical protein  42.37 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0089414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1259  hypothetical protein  41.49 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1433  hypothetical protein  37.94 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3687  hypothetical protein  41.8 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0117  hypothetical protein  39.64 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4067  hypothetical protein  41.67 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0845008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0272  hypothetical protein  31.88 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>