21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3584 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  52.84 
 
 		 778 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0360  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  57.63 
 
 		 736 aa  750    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74904  normal  0.237958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3584  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 		 761 aa  1468    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3580  Lantibiotic dehydratase domain protein  55.34 
 
 		 773 aa  757    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2427  hypothetical protein  34.16 
 
 		 758 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227999  normal  0.0119009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2426  hypothetical protein  34.21 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0137052  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2425  hypothetical protein  32.77 
 
 		 767 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00583554  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3429  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.46 
 
 		 782 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.99 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4059  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.91 
 
 		 845 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.690288  normal  0.527374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.59 
 
 		 811 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  32.14 
 
 		 1035 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.6 
 
 		 811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3274  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.28 
 
 		 749 aa  88.6  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3054  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  40.94 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178849  normal  0.019109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.99 
 
 		 761 aa  62  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.58 
 
 		 895 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3272  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  37.91 
 
 		 761 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  38.18 
 
 		 916 aa  58.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.14 
 
 		 919 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3048  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.74 
 
 		 749 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.202481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>