11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3084 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3084  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03920  hypothetical protein  47.92 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  43.59 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2641  hypothetical protein  32.98 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  39.78 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2684  hypothetical protein  30.1 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  32.53 
 
 		 120 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5661  hypothetical protein  26.45 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4831  hypothetical protein  37.93 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14040  hypothetical protein  28.87 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.593323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2867  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.600163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>