59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2943 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  291  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  45.19 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  43.7 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  44.96 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  42.42 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  39.85 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  39.69 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  35.94 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  34.85 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  36.72 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  32.61 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  30.15 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  29.41 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  30.53 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  33.61 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  31.39 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  29.55 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  31.3 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  29.85 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  29.55 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  30 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  32.46 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  35.29 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  26.67 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  26.15 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  29.41 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.19 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  25.9 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  27.48 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  24.24 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  28.7 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  24.35 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  25.38 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  29.69 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  25.19 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1077  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  24.62 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  28.8 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  25.68 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  28 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  24.31 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  22.61 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  25.37 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  25.56 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  25 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  26.28 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  22.66 
 
 		 156 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  22.14 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  22.14 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  23.08 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  21.54 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  22.07 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>