55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2939 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  292  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  40.69 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  40.41 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  36.73 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  34.75 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  34.04 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  35.04 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  30.5 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  32.39 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  28.89 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  31.97 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  28.37 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  30.56 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  32.87 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  33.68 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  29.17 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  31.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  31.29 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  24.48 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  33.8 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  27.63 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  30.28 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  30.41 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  28.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  28.67 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  27.48 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  26.39 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  28.95 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  27.78 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  25.69 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  31.75 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  24.83 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  25.55 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  24.65 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  26.92 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  29.86 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  27.21 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.6 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  26.36 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  28.67 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  28.46 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  23.53 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  27.69 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  25.2 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  25.2 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  27.61 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  23.78 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  25.2 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>