70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1554 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1554  Chlorite dismutase  100 
 
 
232 aa  477  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24070  hypothetical protein  76.75 
 
 
230 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84912  normal  0.0210051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1891  Chlorite dismutase  67.7 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.297673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2265  Chlorite dismutase  66.81 
 
 
234 aa  309  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.557365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1476  chlorite dismutase  65.49 
 
 
233 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166814  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3917  chlorite dismutase  63.2 
 
 
233 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1534  chlorite dismutase  63.72 
 
 
233 aa  297  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962183  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2827  Chlorite dismutase  65.04 
 
 
236 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2214  chlorite dismutase  61.64 
 
 
234 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2260  chlorite dismutase  61.64 
 
 
234 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2203  chlorite dismutase  61.64 
 
 
234 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451724  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1766  Chlorite dismutase  64.73 
 
 
238 aa  293  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000058609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12691  hypothetical protein  62.45 
 
 
231 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.90726e-33  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3926  Chlorite dismutase  64 
 
 
241 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3671  chlorite dismutase  64.47 
 
 
240 aa  291  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1587  Chlorite dismutase  64.32 
 
 
243 aa  291  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06265  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2483  chlorite dismutase  62.07 
 
 
234 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.359511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2261  chlorite dismutase  63.39 
 
 
237 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.267683  normal  0.0759914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2406  Chlorite dismutase  64.44 
 
 
238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  hitchhiker  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6718  hypothetical protein  60.18 
 
 
235 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15650  hypothetical protein  59.56 
 
 
241 aa  278  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1894  Chlorite dismutase  60.17 
 
 
236 aa  274  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1089  Chlorite dismutase  60.47 
 
 
247 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1896  hypothetical protein  62.11 
 
 
233 aa  269  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6785  Chlorite dismutase  57.52 
 
 
252 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.777367  normal  0.25282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08350  hypothetical protein  60.65 
 
 
250 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5173  chlorite dismutase  55.8 
 
 
254 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000990081  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2623  Chlorite dismutase  57.27 
 
 
255 aa  258  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1885  Chlorite dismutase  57.89 
 
 
241 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1336  chlorite dismutase  56.25 
 
 
231 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486629  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1546  Chlorite dismutase  55 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.18455  normal  0.203099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1380  chlorite dismutase  51.57 
 
 
230 aa  225  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.138403  normal  0.465686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2491  Chlorite dismutase  52.83 
 
 
233 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0151  Chlorite dismutase  57.22 
 
 
222 aa  218  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2769  chlorite dismutase  50.94 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0051176  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15210  hypothetical protein  50.23 
 
 
238 aa  204  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26770  hypothetical protein  45.85 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.379251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0515  chlorite dismutase  30.22 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0747  chlorite dismutase  31.75 
 
 
240 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1710  chlorite dismutase  31.46 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3545  chlorite dismutase  28.22 
 
 
232 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.84719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2990  Chlorite dismutase  27.96 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1747  chlorite dismutase  25.94 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127686  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1404  Chlorite dismutase  29.47 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2027  chlorite dismutase  26.18 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2898  Chlorite dismutase  28.48 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0610  putative heme peroxidase  23.72 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0625  putative heme peroxidase  23.72 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0235  putative heme peroxidase  23.81 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0723  chlorite dismutase  24.53 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.996337  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3909  putative heme peroxidase  26.98 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2580  chlorite dismutase  24.88 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0889379  normal  0.359618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5483  putative heme peroxidase  26.2 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5239  putative heme peroxidase  26.2 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5069  putative heme peroxidase  26.2 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5086  putative heme peroxidase  26.2 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5637  putative heme peroxidase  26.2 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5567  putative heme peroxidase  26.2 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5517  putative heme peroxidase  25.75 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3473  putative heme peroxidase  24 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3365  putative heme peroxidase  24.73 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0342697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5511  putative heme peroxidase  25.32 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5181  putative heme peroxidase  25.32 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5440  putative heme peroxidase  25.32 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2033  Chlorite dismutase  31.19 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1765  Chlorite dismutase  32.32 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1250  hypothetical protein  28.85 
 
 
685 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249744  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1843  Chlorite dismutase  30.39 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1222  hypothetical protein  26.67 
 
 
699 aa  48.5  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2193  Chlorite dismutase  25 
 
 
520 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.242985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>