13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1489 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  59.04 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  47.03 
 
 		 408 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  45.91 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  44.12 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  38.32 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  35.98 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  27.81 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  29.43 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  35.62 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  27.94 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  39.36 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  33.74 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>