30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1006 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  71.89 
 
 		 185 aa  261  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  50.52 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  49.48 
 
 		 194 aa  151  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  46.88 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  46.88 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  46.88 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  42.78 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 218 aa  131  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1288  Domain of unknown function DUF2017  43.46 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  43.17 
 
 		 174 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  42.47 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  39.25 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  32.32 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  38.17 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  34.21 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  37.3 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  35.98 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  41.06 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  36.05 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  31.05 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  33.51 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  34.69 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  31.35 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  29.73 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  31.1 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  30.82 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  27.52 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>