50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0388 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2956  hypothetical protein  59.43 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34720  hypothetical protein  63.32 
 
 		 229 aa  239  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3179  hypothetical protein  55.5 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3908  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  58.72 
 
 		 219 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3309  hypothetical protein  39.91 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0382594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1709  hypothetical protein  37.7 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1639  hypothetical protein  28.25 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1560  hypothetical protein  35 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6761  hypothetical protein  33.85 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2287  hypothetical protein  35.08 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15770  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0917731  normal  0.361516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3294  hypothetical protein  33.79 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900451  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2876  hypothetical protein  31.53 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0620073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1932  hypothetical protein  35.71 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.748587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1519  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1484  hypothetical protein  36.08 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2195  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2241  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0569668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1449  hypothetical protein  35.05 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.301993  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2184  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  hitchhiker  0.00922268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1706  hypothetical protein  35.61 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0678311  normal  0.108804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1639  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3758  hypothetical protein  33.01 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000411746  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2471  hypothetical protein  30.54 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14520  hypothetical protein  31.47 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1407  hypothetical protein  28.17 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2255  hypothetical protein  30.54 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000168856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5193  hypothetical protein  32.89 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24230  hypothetical protein  31.16 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.60384  normal  0.0961367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0260  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3929  hypothetical protein  30.92 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056579  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1321  hypothetical protein  32.49 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4529  hypothetical protein  29 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2905  hypothetical protein  25.84 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1080  hypothetical protein  27.32 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.990505  normal  0.0894269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1887  integral membrane alanine and leucine rich protein  24.4 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2125  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  31.03 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1875  hypothetical protein  27.44 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5606  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  33.81 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal  0.259216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5226  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  33.81 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5314  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  33.81 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13090  hypothetical protein  33.5 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2576  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0492  hypothetical protein  20.91 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.165754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1919  hypothetical protein  29.47 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4236  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  29.53 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12708  hypothetical protein  26.46 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0664757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16150  hypothetical protein  39.44 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.596179  normal  0.161793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>