50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1423 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  43.59 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  36.42 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  31.82 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  30.46 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  29.58 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  33.77 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  31.33 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  32.24 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  29.58 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  29.22 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  29.22 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  31.71 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  28.57 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  26.49 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1730  hypothetical protein  26.22 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000514392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  27.63 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  25.33 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  26.32 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  26.49 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  28.08 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  28.08 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  28.77 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  29.17 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  26.32 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  30.07 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  26.71 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  28.68 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  27.56 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  27.89 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  27.14 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  28.12 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1729  hypothetical protein  24.52 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000276376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  23.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  23.49 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  26.35 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  28.29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  25.85 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  26.8 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  29.14 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  28.05 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  24.84 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  21.33 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  27.96 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  26.28 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  26.22 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>