72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1420 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  324  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  52.45 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  56.12 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  37.04 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  31.65 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  34.06 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  31.16 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  29.71 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  32.37 
 
 
142 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  30.99 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  32.87 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  32.12 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  31.03 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  29.84 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  29.84 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  31.11 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  33.33 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  30.16 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  27.74 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  30.65 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  30.88 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  27.21 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  29.17 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  34.11 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  26.12 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  32.61 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  29.5 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  32.85 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  29.13 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  27.05 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  29.71 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  28.91 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  28.26 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  31.39 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  24.83 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  26.87 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  25.74 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  29.75 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  27.05 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  29.01 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  26.15 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  26.92 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.77 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  28.03 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  25.19 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  27.69 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  31.16 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.36 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  32.86 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  25.71 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  29.41 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  29.36 
 
 
147 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  25.85 
 
 
176 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  23.38 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  22.3 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  26.12 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  22.45 
 
 
155 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  23.7 
 
 
159 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  26.19 
 
 
154 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  28.16 
 
 
149 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  30.88 
 
 
174 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  25.87 
 
 
167 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>