53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1222 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  510  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  96.48 
 
 
256 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  95.95 
 
 
259 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  78.91 
 
 
255 aa  387  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  51.3 
 
 
280 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  41.84 
 
 
927 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  35.16 
 
 
937 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  35.02 
 
 
937 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  35.43 
 
 
937 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  34.6 
 
 
942 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  37.93 
 
 
939 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  33.64 
 
 
945 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  33.64 
 
 
945 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  35.55 
 
 
943 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  35.19 
 
 
938 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  36.26 
 
 
924 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  36.54 
 
 
921 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  31.4 
 
 
941 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  34.09 
 
 
941 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  37.66 
 
 
929 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  33.64 
 
 
940 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  33.18 
 
 
942 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  35.89 
 
 
925 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  32.88 
 
 
939 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  34.72 
 
 
941 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  35.89 
 
 
925 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  32.72 
 
 
943 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  34.72 
 
 
937 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  34.96 
 
 
914 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  35.02 
 
 
941 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  34.26 
 
 
958 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  36.04 
 
 
919 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  35.29 
 
 
939 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  30.45 
 
 
949 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  30 
 
 
948 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  37.91 
 
 
892 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  30 
 
 
957 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  33.94 
 
 
939 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  32.58 
 
 
827 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  38.12 
 
 
940 aa  85.9  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  26.48 
 
 
932 aa  83.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  26 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  34.39 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  26.84 
 
 
184 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  28.12 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  29.59 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  25.99 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  27.23 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  28 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  29.85 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  26.02 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  24.75 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>