31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2684 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  53.77 
 
 
323 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  42.48 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  42.77 
 
 
334 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  42.21 
 
 
328 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  35.58 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  33.65 
 
 
456 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  36.99 
 
 
361 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  36.51 
 
 
369 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  36.51 
 
 
374 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  33.98 
 
 
318 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  36.18 
 
 
349 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  39.27 
 
 
324 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  34.75 
 
 
321 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  38.82 
 
 
342 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  32.88 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.31 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  32.52 
 
 
319 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  32.52 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  26.75 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  38.33 
 
 
779 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.4 
 
 
366 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  28.04 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  25.65 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  20 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  36.21 
 
 
359 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.76 
 
 
350 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  36.94 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  27.44 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  24.02 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  31.31 
 
 
316 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>