22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4226 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  100 
 
 
599 aa  1232    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  53.69 
 
 
555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  50.93 
 
 
565 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  50.93 
 
 
565 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  50.84 
 
 
565 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  51.47 
 
 
560 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  39.06 
 
 
565 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  39.11 
 
 
545 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  37.09 
 
 
562 aa  350  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  35.78 
 
 
564 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  35.38 
 
 
576 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  34.81 
 
 
552 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  34.02 
 
 
555 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  34.12 
 
 
574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  25.33 
 
 
706 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  45.36 
 
 
177 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  26.61 
 
 
886 aa  81.3  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  26.45 
 
 
671 aa  80.5  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3161  hypothetical protein  24.69 
 
 
664 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2965  hypothetical protein  25.4 
 
 
668 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.711778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3053  hypothetical protein  24.51 
 
 
664 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2908  hypothetical protein  23.53 
 
 
663 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0753895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>