19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3002 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  100 
 
 
125 aa  247  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  29.75 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  29.77 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2043  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 
123 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31350  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  31.58 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  28.46 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  32 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  25.2 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  29.41 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  29.91 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  27.12 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  29.63 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  28.07 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  35.87 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  25.83 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  24.19 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  29.03 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  29.06 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>