38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1597 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1597  integral membrane protein  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000148596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1603  integral membrane protein  90.73 
 
 
254 aa  447  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287365  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13380  hypothetical protein  55.31 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.698481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15390  hypothetical protein  53.3 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.920438  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1857  integral membrane protein  49.79 
 
 
242 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2110  hypothetical protein  47.95 
 
 
245 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0782163  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2036  hypothetical protein  52.36 
 
 
241 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.762589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1482  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  218  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.354113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3289  integral membrane protein  46.61 
 
 
243 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16480  hypothetical protein  43.91 
 
 
248 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.693416  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16390  hypothetical protein  41.42 
 
 
257 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185434  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1265  hypothetical protein  38.01 
 
 
228 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117366  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0990  putative integral membrane protein  36.51 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0153454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7408  integral membrane protein  35.57 
 
 
242 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3371  hypothetical protein  36.56 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2298  hypothetical protein  36.55 
 
 
238 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1512  hypothetical protein  35.21 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0938  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07520  hypothetical protein  38.89 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3583  hypothetical protein  35.35 
 
 
250 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228317  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2632  hypothetical protein  34.82 
 
 
226 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2931  hypothetical protein  35.35 
 
 
243 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3078  hypothetical protein  38.32 
 
 
247 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0234116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3100  hypothetical protein  36.2 
 
 
230 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.274656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12247  transmembrane protein  36.54 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0925  hypothetical protein  34.08 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3379  hypothetical protein  35.48 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286158  normal  0.154521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3317  hypothetical protein  35.48 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3328  hypothetical protein  35.48 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0819356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0827  hypothetical protein  30.74 
 
 
260 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1772  putative integral membrane protein  35.12 
 
 
336 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0927  hypothetical protein  40.38 
 
 
242 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0410  hypothetical protein  30.32 
 
 
277 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3330  hypothetical protein  35.5 
 
 
229 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0172089  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1918  hypothetical protein  33.49 
 
 
252 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00709075  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3566  hypothetical protein  35.93 
 
 
229 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3140  hypothetical protein  30.29 
 
 
288 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4894  hypothetical protein  31.05 
 
 
232 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>