27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2141 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  100 
 
 
820 aa  1584    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  31.13 
 
 
706 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  28.67 
 
 
835 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  28.34 
 
 
870 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  29.89 
 
 
713 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  29.42 
 
 
784 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  32.38 
 
 
814 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  29.84 
 
 
919 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  31.04 
 
 
884 aa  111  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  28 
 
 
873 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  26.87 
 
 
703 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  27.48 
 
 
706 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  31.45 
 
 
820 aa  73.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  27.02 
 
 
764 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  29.98 
 
 
717 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  31.19 
 
 
751 aa  64.3  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4682  hypothetical protein  26.18 
 
 
735 aa  62.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  29.87 
 
 
728 aa  60.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  31.07 
 
 
711 aa  61.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  23.77 
 
 
741 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  32.41 
 
 
905 aa  57.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  30.73 
 
 
809 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  30.73 
 
 
809 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  30.73 
 
 
809 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  30.54 
 
 
802 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  29.94 
 
 
811 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  29.03 
 
 
804 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>