33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1690 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  42.41 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  41.08 
 
 
175 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  37.63 
 
 
194 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  38.38 
 
 
182 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  38.12 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  40.86 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  39.52 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  39.52 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  35.38 
 
 
185 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  40.27 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  39.23 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  36.36 
 
 
177 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  38.41 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  35.95 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  31.16 
 
 
185 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  33.14 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  30.11 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  32.58 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  28.98 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  31.76 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  34.62 
 
 
165 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  33.12 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  35.19 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  34.75 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  32.29 
 
 
254 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  31.29 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  30.41 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  27.14 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  27.14 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  27.14 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>