13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0117 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0117  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1381  hypothetical protein  42.92 
 
 
238 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.294296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1433  hypothetical protein  42.74 
 
 
259 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208283  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2014  hypothetical protein  40.81 
 
 
230 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00715449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0776  hypothetical protein  40.34 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8785  hypothetical protein  43.78 
 
 
244 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3687  hypothetical protein  42.11 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4067  hypothetical protein  43.32 
 
 
233 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0845008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1259  hypothetical protein  39.13 
 
 
253 aa  118  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2613  hypothetical protein  36.32 
 
 
241 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0089414  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4496  hypothetical protein  37.67 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0272  hypothetical protein  34.89 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
131 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>