17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0642 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0642  flagella protein  100 
 
 
114 aa  230  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  35.44 
 
 
706 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1001  flagella protein  34 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0944  flagella protein  34 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0971  flagella protein  32 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0970  flagella protein  33.33 
 
 
337 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  30.93 
 
 
428 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  28.36 
 
 
348 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1736  flagella protein  32 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1002  flagella protein  31.37 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  33.33 
 
 
553 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0943  flagella protein  30.39 
 
 
317 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.921753  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1737  flagella protein  28.07 
 
 
304 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  28.77 
 
 
162 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0263  flagella protein  31.03 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106201  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  29.17 
 
 
573 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0262  flagella protein  25.21 
 
 
295 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.377793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>