32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0565 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  47.31 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  46.39 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  43.48 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  42.39 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  41.3 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  44.57 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  43.33 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  40.4 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  39.8 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  42.39 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  41.3 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  41.3 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  36.67 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  42.05 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  41.3 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  39.39 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  42.05 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  37.08 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  39.02 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  32.99 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  33.68 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  35.42 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  33.72 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  37.78 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  34.69 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  36.36 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  32.22 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.14 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  26.83 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  30 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  41.18 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>