22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0421 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 
101 aa  204  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  42.7 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  41.41 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  38.2 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  41.86 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.33 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  38.2 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1998  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  42.7 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0296724 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  37.08 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1578  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  45.12 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.08 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  39.58 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.05 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.79 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.475377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.7 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.96 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.96 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.96 
 
 
110 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0214  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  38.46 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.64 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  29.79 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0533  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.97 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000671955  normal  0.92433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>