20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0143 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  100 
 
 
348 aa  685    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  41.26 
 
 
428 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  25 
 
 
706 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1002  flagella protein  28.97 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0970  flagella protein  27.3 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1001  flagella protein  26.57 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0944  flagella protein  26.57 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0971  flagella protein  27.27 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1736  flagella protein  27.27 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0943  flagella protein  31.85 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.921753  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1737  flagella protein  31.85 
 
 
304 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0262  flagella protein  27.27 
 
 
295 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.377793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0263  flagella protein  26.57 
 
 
136 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3416  Flagella accessory C family protein  22.41 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2872  Flagella accessory C family protein  29.27 
 
 
811 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.899166  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0642  flagella protein  28.69 
 
 
114 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  27.54 
 
 
573 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  31.34 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2868  Flagella accessory C family protein  33.33 
 
 
482 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  34.25 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>