30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0507 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0507  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  296  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0953  hypothetical protein  81.1 
 
 
136 aa  203  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2389  hypothetical protein  78.12 
 
 
136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2191  hypothetical protein  77.95 
 
 
136 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1189  hypothetical protein  70 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651211  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1169  hypothetical protein  69.47 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4174  hypothetical protein  70.54 
 
 
136 aa  181  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950155  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3419  hypothetical protein  67.94 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  0.0716917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1261  hypothetical protein  67.94 
 
 
132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1403  hypothetical protein  67.94 
 
 
132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2854  hypothetical protein  70.31 
 
 
132 aa  180  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2348  hypothetical protein  67.94 
 
 
132 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000206285  unclonable  0.000000125887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1631  hypothetical protein  64.84 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0440  hypothetical protein  66.39 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0678  hypothetical protein  74.8 
 
 
142 aa  166  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.450088  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4510  hypothetical protein  50.39 
 
 
128 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59890  hypothetical protein  49.61 
 
 
128 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571428  hitchhiker  0.00000000000107847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3018  hypothetical protein  53.91 
 
 
137 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1447  hypothetical protein  48.03 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36230  hypothetical protein  52.07 
 
 
130 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3325  hypothetical protein  50.83 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2943  hypothetical protein  50.83 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0866  hypothetical protein  51.92 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1759  hypothetical protein  34.75 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3710  hypothetical protein  35.16 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0655  hypothetical protein  36.15 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0332  hypothetical protein  32.28 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.134237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4174  hypothetical protein  32.28 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4091  hypothetical protein  32.28 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3931  hypothetical protein  27.07 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>