41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1338 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1055    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  51.57 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  52.99 
 
 		 504 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  52.18 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  49.11 
 
 		 510 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  49.11 
 
 		 502 aa  541  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  51 
 
 		 504 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  48.51 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  48.44 
 
 		 484 aa  508  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  42.8 
 
 		 509 aa  438  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  34.26 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  34.58 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  34.86 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  35.11 
 
 		 510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  35.02 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  36.08 
 
 		 514 aa  316  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  36.08 
 
 		 514 aa  316  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  34.99 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  35.43 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  34.27 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  33.8 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  33.06 
 
 		 522 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  32.58 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  32.23 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  31.67 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  32.62 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  32.7 
 
 		 512 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  33.01 
 
 		 527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  28.6 
 
 		 528 aa  237  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  29.84 
 
 		 508 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  31.78 
 
 		 530 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  30.53 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  30.67 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  30.82 
 
 		 539 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  22.95 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.88 
 
 		 557 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  23.43 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  24.51 
 
 		 581 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  22.51 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  26.02 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  23.27 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>