17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_09097 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  73.77 
 
 
135 aa  183  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  58.27 
 
 
130 aa  148  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  54.47 
 
 
137 aa  142  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  60 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  42.05 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  29.89 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  32.91 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  31.65 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  29.11 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  36.25 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  26.58 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  29.11 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  34.21 
 
 
112 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  30.38 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  29.63 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  30.56 
 
 
99 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>