9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1305 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3462  hypothetical protein  71.37 
 
 		 455 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1305  transposon transposase  100 
 
 		 464 aa  957    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1269  transposase IS605 OrfB  31.54 
 
 		 494 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1117  transposase IS605 OrfB  30.67 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000234491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0271  transposase IS605 OrfB  30.37 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000409425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0745  transposase IS605 OrfB  30.06 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00432126  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3228  transposase, IS605 OrfB family  31.34 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1128  transposase, IS605 OrfB family  31.34 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2646  transposase, IS605 OrfB family  28.89 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.866499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>