40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0805 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 514 aa  1032    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  100 
 
 		 514 aa  1032    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  35.73 
 
 		 508 aa  317  4e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  34.57 
 
 		 507 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  36.82 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  33.61 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  34.71 
 
 		 510 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  33.13 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  35.18 
 
 		 497 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  34.92 
 
 		 510 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  34.65 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  33.06 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  36.17 
 
 		 496 aa  291  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  34.57 
 
 		 500 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  34.14 
 
 		 504 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  33.47 
 
 		 504 aa  286  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  33.4 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  34.15 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  38.15 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  32.38 
 
 		 507 aa  283  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  32.26 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  37.23 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  33.06 
 
 		 514 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  33.78 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  36.47 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  35.31 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  35.74 
 
 		 539 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  34.71 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  34.9 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  32.52 
 
 		 508 aa  240  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  29.86 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  29.77 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  33.65 
 
 		 528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  29.68 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.84 
 
 		 557 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  23.66 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  25.52 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  33.98 
 
 		 128 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  34.02 
 
 		 532 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>