14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06871 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_06871  NADH-ubiquinone/plastoquinone protein  100 
 
 
180 aa  357  4e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06581  NADH-ubiquinone/plastoquinone complex I protein  98.89 
 
 
180 aa  354  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0631  NADH-ubiquinone/plastoquinone-like  92.78 
 
 
180 aa  337  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06971  NADH-ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein  80.56 
 
 
180 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07391  NADH-ubiquinone/plastoquinone (comple  43.82 
 
 
185 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633063  normal  0.336325 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0070  NADH-ubiquinone/plastoquinone  47.19 
 
 
186 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.72704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06921  NADH-ubiquinone/plastoquinone (comple  43.86 
 
 
179 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0408  hypothetical protein  43.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.491536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09171  hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0249  hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11001  hypothetical protein  41.03 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732767 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06791  hypothetical protein  31.19 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.563443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0922  hypothetical protein  32.1 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15401  hypothetical protein  35.44 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>