Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | A9601_06451 |
Symbol | |
ID | 4717347 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Prochlorococcus marinus str. AS9601 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_008816 |
Strand | + |
Start bp | 564236 |
End bp | 568132 |
Gene Length | 3897 bp |
Protein Length | 1298 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 26% |
IMG OID | 640078358 |
Product | hypothetical protein |
Protein accession | YP_001009038 |
Protein GI | 123968180 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGCTTTTAC CTTTAGGTTT TTTAGGCACT TTTTTATTAA ATAATTTTTT AAAAGACACT TATAGTTCTA GGAAATTAGA ACTAGAAAAA AGTCTTGAGA ATCTTTTAGA TAAAAATGTT GATTTAGGTG ATTATGTTGG GATTAGATAT CTAGGTATTT CTTTGGGTAA TTCAAAAATT AATGATAAAA ACAATTTAGA TTCTGAAATT ACAGCCAAAA ATGTATATGT TGGCATTATG CCTTTTAGAT CTTTTTTAAA ACAAAAATGG ATTGTAAAAA TAAGTCCTAA GGAAGCTGCC ATAAATATAG ATAGAGATTT TTTTAAAAGG GACGAATCTT ATAAAGATAA TCGAATTGCA AAAAAATCAA AATCTAAGTA TGAGTTGATC TTTAACTTAA ATAAATATTC AGATCTGAAG TTTAATAATG CAGGATTAAA AACAAAAGTA AAAGGTAATG TTATTTACAA GTCAAGAAAT AGACAAATCA TTGCAAATGT AAAATCAAAT TTTGATGAAA AGGGATTTTT AAAATTTAAA TTTAATACAA AATTAAATCA AGACTTTTTA AAACTGGATT TATTTTCTAA GGGTTTAGAT CTTGATAATT CTGAATATAT AATTGGCAAT AGAAAAATTA GCTTTAAAAA AGGTACCTTT AAATCTAACT TTAAATTTAA TAAATCATCA AAGCACACAT TTTGTGAAGG AAGATTTTCT TTTACTAATT TAAAAATAAA ACCAGAAGAT TTAGCAGAGA ATATAAATTC AGATTCAACT AGGTTTTTTT GTAAAGATAA TAATTTTATT GGTAATACAG AAAAATTAAA TTATGGAACT TTGACTTCGA ATTTTAATCT AAATATGCCC TTTAATAGAA GCTCCAATAA TATTGATCTA AAAGGAAGTA TTGGATACAT TAATAGCCTT AATCCAGATA TCCAATTATC GGGTAATATG CCCTTTTGGT TTGATAGAAG AGGTATAAAT TTTGGTGATA TAGATACTAG TTTTAAAATA AATAGAACTC AATTATCTAA TTTAAATATT TTCCGAAAAA ATGATATAAG GGGTTTCATT ACTGCTAAAG GTGAATTAAA AGGAAAAATT ACTGATCCTG ATATTTCGAT AAACTTTAAC CTTGATTACC CGCACTTTAA AGGTATCCGC ATTAGAGAAA TATGGGAGGG AGATATTAAA AATGAAAATA ATGAATTTCT TCTTAATATG AAAAATAGAT ATTCTCCAAT CCCTTCATTT CTTTCAATCA ACTTTAATTC TGATCTTAAA ATAAATAATG CAAATTTCAT AAGAGTTTTC AATTCAAATA AAGGTACTAT AGGCATACTG AAACAGGATG ATGGTTATAA TTGGCGAGCG GATAATTTTC CTCTTGATGA GCTTGAATTA TCTATAGACA AAAATCAATT CGATAGAATT TATGGAATTA TTAATGGTAA AGGATCAATT TCGTCAGACC AGTCATACCT TGATGGGCGA ATTGCTTGGA GTCTAGGTAA ATATAGAAAT ATTAATCTAG CCAATTCATT ATTTGATTTC CGCGTCAAAG ATAATTCTTT TTATATAAAC TCCTCATTGT ATCCAATTGA TGGAGGAATA ATTGAAGTCG AATATGATTC AAGTAAAAAT AATTTTATTA ATTCAGAATT CAAGGATATA AGCACTAGTT GGACTATCCT TACCGCTGTT GATATTTTTA ACTTTGATAA TAAAAAAGTG ATTCCTATAA GTAAATCGAA TATTTTGGAT GATTTGGAAA TAAATAAAGA AAATAAATCA CTTAAAGAGA GGATCGATTT TATAAATAAC TTTATTGAAA ATAGTAATTT GTTAGAGGAC AAATTTAATT TGCAAAAATA TTTAAATAAA TTTAGAAGTA GATACAACGG AAAAATTACT ATTCAGGGCG ATAGACCAGT AAATTATAAA TTAAATGCAA AATTAAAGGG CTATCTTGAT GTATCTAGAG ACGTCTATAA GAATAATAAA GAGGAATTTT CTATTGATTT GGAAGGGGGA TTATTAACAG GGAAAGGTTC TTTAAGAATT AAAAAATTTC CATTAAGTGC AGCAAATATC TTTTTAAATA AACCAAGAGA TTTTCTTGGA GGGTTGGATA TGAACTTATT TTATGATCTC GATACAAAAT CTTTCTCTAG CGATATTTTG TCCAATGGTT CATCAATTAA AAACAACATA ATAATATTTG ATAAAGGACT AATTAAATTT AATAATTCTA TTTTTGATAT TGATTTTTCC CTTTTAATAA ATGATTCTGA AATACCAATT AATATCGAAG GTTCAATACC TATAAATAAG TCTGATAACT TAGATCTAAG ATTGATTGGG AATGGAAAAT TTATTGAGTT AATAGATATT TTTGCTGATG AATACTTTAC ATTTAAAGAA GGAGATTTAA ATCTAAGAGT GATTCTAAAA GGAACCTTAA ATAAACCTCT ATTAAATGGA TTTATCGTAG TTAAAGATTC TGAAATTAAT TTTTCAAACA ATATAATAAG AGATTTTAAT AGTACAATCA TCTTTGATTT TGACTCTTTA GAGATCAATA ATCTACAAGC GAAGACTCAA GATTCTGGTG AAATTTTTGT AAAAGGCACT TTGCCTTTTT ATAGTCAGAA TGATTCTGAA AAGTCAGAAA TTAATTTGAT AACGAATAGA TTTTCATTAA AGAAAGATAA TTTTAATTTT TTAATAGATT CAGATATCGA TTTAAGTGGA TCATTTGAAA GTCCTGTTTT GGGAGGTTAT CTATCTTTTA ATAATGGATT TATTAATTTT AATAGCACCA ATCAAAATAA TAAAAAAGAA AATAATCTTA TAAGAAAAGA GGATAAAAAA GATTGGCCAG AACTCTATTG GAATAATAAA AAAAATATTG AAATAATATC AAATGAAACA ATTTTGAATT CAGTTCTTTT AGGAGAAACT TTGCCTAATT ATCTAGGTAA TTTGAGTTTT AATAATCTTA AATTAAAACT TGGACCAGAA TTTAAACTTC AATATTCAGA AATAGTTCAA GCTTATTTAG ATACCAAATT AGACCTTACT ATAAATGGTG AGATAGGAAA TGATTTAAAT GCTAGGGGTC TTATTTACCT TAAGAAAGGA AGAGCAAATC TATACACTAC CCCGTTTAAA CTTAATAAAA ATAAAGACAA TTATATTTTA TTTGCATCAA GAAGTGGTGT GGTTCCTTTT ATAAATTTTT CTTTAGTCAG TAAAGTTCCA GATTCTATAA TACCTATAAG TGAAAACAAT CAGGATTTAA ATGTATCAGG TGATGTTGCT GTCGACGCTA GTTCAAGCGG TTATGGTGCA TTTGGAATTG GTAATACTAG GCTTATCAAA ATTGAAGCAT CTTATGAAGG ATTTTTAGAT CAATTATCTT TCGCTGATGA AAATAGAAGA ATCCAATTAA GGAGTACGCC AAGTTACAAC AGATCACAAA TAATTGGTTT AATTGGAGGT AACTCTGCAA ATTTAATAAA TAGAGCATTT ATTTCTCAAA TTAATAATGC TGATGCATTT AGTGAAAGAT TTCAGTTTTC TTTATATCCA GCGTTAATAG AAAATAATGA TTCATTAAAT AATATTTTTT CCAATGAAAA TTTAGATATA GAAAATGATG ATCAATCCTC TTCTAATGAG GAATTTTCTT CTCAAGCTTG GGTAGCCGAA ATAGGGCTTG ATATTACTGA TGCGATAAAT TTTGCCTTTC AAACAGTTCC AGGTAGAGAT GATATTTCAC CTTTAGGAAT TTTGACTTTT CAGGCAAATC CAAACTTAGA ATTATTAGGT TCTTATGATT CCAATGGGGA TTGGAAAAGT CAAGTTCAGT TATTTTTTAG ATATTAA
|
Protein sequence | MLLPLGFLGT FLLNNFLKDT YSSRKLELEK SLENLLDKNV DLGDYVGIRY LGISLGNSKI NDKNNLDSEI TAKNVYVGIM PFRSFLKQKW IVKISPKEAA INIDRDFFKR DESYKDNRIA KKSKSKYELI FNLNKYSDLK FNNAGLKTKV KGNVIYKSRN RQIIANVKSN FDEKGFLKFK FNTKLNQDFL KLDLFSKGLD LDNSEYIIGN RKISFKKGTF KSNFKFNKSS KHTFCEGRFS FTNLKIKPED LAENINSDST RFFCKDNNFI GNTEKLNYGT LTSNFNLNMP FNRSSNNIDL KGSIGYINSL NPDIQLSGNM PFWFDRRGIN FGDIDTSFKI NRTQLSNLNI FRKNDIRGFI TAKGELKGKI TDPDISINFN LDYPHFKGIR IREIWEGDIK NENNEFLLNM KNRYSPIPSF LSINFNSDLK INNANFIRVF NSNKGTIGIL KQDDGYNWRA DNFPLDELEL SIDKNQFDRI YGIINGKGSI SSDQSYLDGR IAWSLGKYRN INLANSLFDF RVKDNSFYIN SSLYPIDGGI IEVEYDSSKN NFINSEFKDI STSWTILTAV DIFNFDNKKV IPISKSNILD DLEINKENKS LKERIDFINN FIENSNLLED KFNLQKYLNK FRSRYNGKIT IQGDRPVNYK LNAKLKGYLD VSRDVYKNNK EEFSIDLEGG LLTGKGSLRI KKFPLSAANI FLNKPRDFLG GLDMNLFYDL DTKSFSSDIL SNGSSIKNNI IIFDKGLIKF NNSIFDIDFS LLINDSEIPI NIEGSIPINK SDNLDLRLIG NGKFIELIDI FADEYFTFKE GDLNLRVILK GTLNKPLLNG FIVVKDSEIN FSNNIIRDFN STIIFDFDSL EINNLQAKTQ DSGEIFVKGT LPFYSQNDSE KSEINLITNR FSLKKDNFNF LIDSDIDLSG SFESPVLGGY LSFNNGFINF NSTNQNNKKE NNLIRKEDKK DWPELYWNNK KNIEIISNET ILNSVLLGET LPNYLGNLSF NNLKLKLGPE FKLQYSEIVQ AYLDTKLDLT INGEIGNDLN ARGLIYLKKG RANLYTTPFK LNKNKDNYIL FASRSGVVPF INFSLVSKVP DSIIPISENN QDLNVSGDVA VDASSSGYGA FGIGNTRLIK IEASYEGFLD QLSFADENRR IQLRSTPSYN RSQIIGLIGG NSANLINRAF ISQINNADAF SERFQFSLYP ALIENNDSLN NIFSNENLDI ENDDQSSSNE EFSSQAWVAE IGLDITDAIN FAFQTVPGRD DISPLGILTF QANPNLELLG SYDSNGDWKS QVQLFFRY
|
| |