27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1873 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  94.55 
 
 		 385 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  98.7 
 
 		 385 aa  732    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  65.27 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  24.58 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  24.93 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  24.22 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  24.85 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  26.07 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  22.99 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  23.88 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  22.86 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  27.48 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  28.34 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  22.26 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  24.79 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  26.15 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  22.92 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  25.56 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  25.85 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  22.99 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  24.7 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  25.27 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  22.35 
 
 		 541 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  22.75 
 
 		 541 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1295 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>