137 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dole_0018  CDS  NC_009943  19366  20346  981  hypothetical protein  YP_001527905  unclonable  6.71428e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0034  CDS  NC_009943  38838  41114  2277  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  YP_001527921  unclonable  1.5313e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0035  CDS  NC_009943  41182  42708  1527  SpoIID/LytB domain-containing protein  YP_001527922  unclonable  4.86765e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0036  CDS  NC_009943  42966  43844  879  hypothetical protein  YP_001527923  unclonable  4.61635e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0085  CDS  NC_009943  95607  95825  219  NifU domain-containing protein  YP_001527972  unclonable  2.10342e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0094  CDS  NC_009943  103072  104205  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001527981  unclonable  4.75987e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0155  CDS  NC_009943  169729  172134  2406  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  YP_001528042  unclonable  3.65232e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0183  CDS  NC_009943  201532  202692  1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001528070  unclonable  7.73523e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0184  CDS  NC_009943  202839  203846  1008  TetR family transcriptional regulator  YP_001528071  unclonable  5.05732e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0190  CDS  NC_009943  208138  208707  570  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  YP_001528077  unclonable  6.0037e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0191  CDS  NC_009943  208961  209368  408  hypothetical protein  YP_001528078  unclonable  2.39834e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0267  CDS  NC_009943  305854  306462  609  hypothetical protein  YP_001528154  unclonable  3.77506e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0321  CDS  NC_009943  366345  366842  498  signal peptidase I  YP_001528208  unclonable  5.88302e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0322  CDS  NC_009943  367112  368317  1206  TPR repeat-containing protein  YP_001528209  unclonable  2.4467e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0378  CDS  NC_009943  437232  438944  1713  hypothetical protein  YP_001528265  unclonable  2.22085e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0396  CDS  NC_009943  457317  458156  840  hypothetical protein  YP_001528283  unclonable  2.70968e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0419  CDS  NC_009943  482627  483076  450  hypothetical protein  YP_001528306  unclonable  2.06114e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0467  CDS  NC_009943  532231  533535  1305  FolC bifunctional protein  YP_001528354  unclonable  3.74021e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0468  CDS  NC_009943  533608  533814  207  ribosomal protein S21  YP_001528355  unclonable  1.23547e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0469  CDS  NC_009943  534043  534717  675  adenylate kinase  YP_001528356  unclonable  1.09629e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0473  CDS  NC_009943  537952  538845  894  HemK family modification methylase  YP_001528360  unclonable  3.02756e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0517  CDS  NC_009943  583148  583603  456  tfp pilus assembly protein, major pilin  YP_001528404  unclonable  6.83927e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0538  CDS  NC_009943  605473  606258  786  glutamate racemase  YP_001528425  unclonable  1.09629e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0545  CDS  NC_009943  611105  612205  1101  HflK protein  YP_001528432  unclonable  8.73771e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0546  CDS  NC_009943  612202  613191  990  HflC protein  YP_001528433  unclonable  4.95565e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0595  CDS  NC_009943  665691  667595  1905  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001528482  unclonable  7.85776e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0596  CDS  NC_009943  667592  668698  1107  rod shape-determining protein RodA  YP_001528483  unclonable  1.43295e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0597  CDS  NC_009943  668796  669161  366  hypothetical protein  YP_001528484  unclonable  3.58877e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0598  CDS  NC_009943  669338  669856  519  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  YP_001528485  unclonable  8.87819e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0646  CDS  NC_009943  770132  770458  327  hypothetical protein  YP_001528533  unclonable  1.49489e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0647  CDS  NC_009943  770465  772162  1698  hypothetical protein  YP_001528534  unclonable  1.86884e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0670  CDS  NC_009943  793060  794853  1794  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001528557  unclonable  4.45499e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0689  CDS  NC_009943  814816  817458  2643  hypothetical protein  YP_001528576  unclonable  4.26728e-06  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0794  CDS  NC_009943  922791  924263  1473  sodium/sulphate symporter  YP_001528681  unclonable  4.96756e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0833  CDS  NC_009943  966496  967647  1152  extracellular ligand-binding receptor  YP_001528720  unclonable  2.52201e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0927  CDS  NC_009943  1081454  1081915  462  hypothetical protein  YP_001528814  unclonable  2.37376e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0929  CDS  NC_009943  1083873  1085498  1626  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001528816  unclonable  1.15197e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0935  CDS  NC_009943  1092320  1093039  720  putative lipoprotein  YP_001528822  unclonable  2.3055e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0936  CDS  NC_009943  1093415  1093669  255  XRE family transcriptional regulator  YP_001528823  unclonable  1.55637e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0946  CDS  NC_009943  1103629  1104066  438  50S ribosomal protein L13  YP_001528833  unclonable  3.05629e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0947  CDS  NC_009943  1104138  1104428  291  hypothetical protein  YP_001528834  unclonable  1.28628e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0996  CDS  NC_009943  1168841  1169089  249  hypothetical protein  YP_001528883  unclonable  5.32079e-12  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0997  CDS  NC_009943  1169143  1169577  435  adenylylsulfate reductase, beta subunit  YP_001528884  unclonable  1.60425e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0998  CDS  NC_009943  1169657  1171636  1980  adenylylsulfate reductase subunit alpha  YP_001528885  unclonable  1.0424e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1003  CDS  NC_009943  1178563  1181028  2466  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  YP_001528890  unclonable  1.03924e-06  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1221  CDS  NC_009943  1456597  1458936  2340  FG-GAP repeat-containing protein  YP_001529104  unclonable  3.16782e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1242  CDS  NC_009943  1482951  1483589  639  TetR family transcriptional regulator  YP_001529125  unclonable  5.3734e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1319  CDS  NC_009943  1571618  1572052  435  hypothetical protein  YP_001529200  unclonable  3.77506e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1410  CDS  NC_009943  1677292  1677705  414  hypothetical protein  YP_001529291  unclonable  2.60045e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1461  CDS  NC_009943  1743547  1745517  1971  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  YP_001529342  unclonable  6.68721e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1578  CDS  NC_009943  1878829  1880637  1809  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  YP_001529459  unclonable  3.46283e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1591  CDS  NC_009943  1893428  1893889  462  putative lipoprotein  YP_001529472  unclonable  3.51664e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1592  CDS  NC_009943  1893912  1895114  1203  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_001529473  unclonable  1.84282e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1613  CDS  NC_009943  1917887  1918459  573  hypothetical protein  YP_001529494  unclonable  4.39134e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1614  CDS  NC_009943  1918597  1918857  261  hypothetical protein  YP_001529495  unclonable  9.60734e-12  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1619  CDS  NC_009943  1923473  1925581  2109  hypothetical protein  YP_001529500  unclonable  1.30275e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1659  CDS  NC_009943  1972700  1973959  1260  hypothetical protein  YP_001529540  unclonable  2.2104e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1717  CDS  NC_009943  2060636  2060908  273  histone family protein DNA-binding protein  YP_001529598  unclonable  2.93556e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1747  CDS  NC_009943  2098060  2098815  756  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  YP_001529628  unclonable  1.51297e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1751  CDS  NC_009943  2102649  2104868  2220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001529632  unclonable  4.03913e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1752  CDS  NC_009943  2105028  2105933  906  diguanylate cyclase  YP_001529633  unclonable  3.21576e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1753  CDS  NC_009943  2106130  2108436  2307  FG-GAP repeat-containing protein  YP_001529634  unclonable  5.43044e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1755  CDS  NC_009943  2111080  2113161  2082  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001529636  unclonable  1.87342e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1756  CDS  NC_009943  2113603  2115729  2127  FG-GAP repeat-containing protein  YP_001529637  unclonable  2.41186e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1757  CDS  NC_009943  2115767  2117959  2193  FG-GAP repeat-containing protein  YP_001529638  unclonable  2.92234e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1792  CDS  NC_009943  2170069  2172867  2799  hypothetical protein  YP_001529673  unclonable  5.2319e-06  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1859  CDS  NC_009943  2249026  2251086  2061  TonB-dependent receptor plug  YP_001529740  unclonable  1.4407e-07  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1908  CDS  NC_009943  2310787  2312028  1242  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  YP_001529789  unclonable  1.99693e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1980  CDS  NC_009943  2395843  2396742  900  signal peptide peptidase SppA, 36K type  YP_001529861  unclonable  2.6819e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1981  CDS  NC_009943  2396865  2398679  1815  ribosomal protein S1  YP_001529862  unclonable  2.04813e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1982  CDS  NC_009943  2398785  2399453  669  cytidylate kinase  YP_001529863  unclonable  4.05125e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1983  CDS  NC_009943  2399450  2400538  1089  histidinol-phosphate aminotransferase  YP_001529864  unclonable  4.38985e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1984  CDS  NC_009943  2400673  2401845  1173  hypothetical protein  YP_001529865  unclonable  7.50429e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_1995  CDS  NC_009943  2416217  2417383  1167  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001529876  unclonable  2.05838e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2004  CDS  NC_009943  2426708  2428612  1905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_001529885  unclonable  4.23635e-08  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2005  CDS  NC_009943  2428854  2430287  1434  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_001529886  unclonable  3.18218e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2023  CDS  NC_009943  2451296  2452069  774  hypothetical protein  YP_001529904  unclonable  1.1532e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2051  CDS  NC_009943  2500589  2501335  747  hypothetical protein  YP_001529932  unclonable  1.94447e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2052  CDS  NC_009943  2501690  2502928  1239  glycosyl transferase group 1  YP_001529933  unclonable  2.8188e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2053  CDS  NC_009943  2503203  2503544  342  hypothetical protein  YP_001529934  unclonable  2.54819e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2054  CDS  NC_009943  2504046  2505314  1269  hypothetical protein  YP_001529935  unclonable  2.65297e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2055  CDS  NC_009943  2505311  2506078  768  DNA uptake lipoprotein-like protein  YP_001529936  unclonable  1.88643e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2056  CDS  NC_009943  2506165  2506356  192  50S ribosomal protein L28  YP_001529937  unclonable  8.51837e-12  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2063  CDS  NC_009943  2514490  2515647  1158  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001529944  unclonable  8.917e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2087  CDS  NC_009943  2535879  2537207  1329  hypothetical protein  YP_001529968  unclonable  4.22239e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2119  CDS  NC_009943  2574519  2574815  297  plasmid stabilization system protein  YP_001530000  unclonable  2.47213e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2120  CDS  NC_009943  2574812  2575093  282  prevent-host-death family protein  YP_001530001  unclonable  2.25731e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2159  CDS  NC_009943  2618915  2619508  594  SirA family protein  YP_001530040  unclonable  1.02186e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2160  CDS  NC_009943  2619688  2620941  1254  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001530041  unclonable  3.11819e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2183  CDS  NC_009943  2651774  2652277  504  rubrerythrin  YP_001530064  unclonable  2.23416e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2184  CDS  NC_009943  2652520  2653137  618  dephospho-CoA kinase  YP_001530065  unclonable  4.48141e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2185  CDS  NC_009943  2653191  2654474  1284  lytic transglycosylase catalytic  YP_001530066  unclonable  2.12239e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2247  CDS  NC_009943  2722631  2723914  1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001530128  unclonable  1.1371e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2304  CDS  NC_009943  2792298  2792651  354  ribosomal protein L19  YP_001530185  unclonable  9.80437e-12  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2362  CDS  NC_009943  2846026  2846976  951  hypothetical protein  YP_001530243  unclonable  7.278e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2363  CDS  NC_009943  2847020  2847763  744  lipid-binding START domain-containing protein  YP_001530244  unclonable  2.4252e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2364  CDS  NC_009943  2847979  2849040  1062  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  YP_001530245  unclonable  1.00727e-09  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2365  CDS  NC_009943  2849207  2849977  771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001530246  unclonable  2.47495e-10  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2383  CDS  NC_009943  2872703  2873176  474  hypothetical protein  YP_001530264  unclonable  2.8196e-11  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_2384  CDS  NC_009943  2873566  2876187  2622  hypothetical protein  YP_001530265  unclonable  2.29491e-06  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>