33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dd703_0229  CDS  NC_012880  259192  261747  2556  adenylate cyclase  YP_002985868  unclonable  7.02171e-05  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0398  CDS  NC_012880  444935  445309  375  ribosomal protein S12  YP_002986033  unclonable  2.13628e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0547  CDS  NC_012880  609963  610661  699  Deoxyribonuclease I  YP_002986180  unclonable  4.80912e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0548  CDS  NC_012880  610762  611274  513  hypothetical protein  YP_002986181  unclonable  2.20186e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0549  CDS  NC_012880  611547  612701  1155  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002986182  unclonable  2.43541e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0654  CDS  NC_012880  737658  738590  933  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_002986287  unclonable  1.12653e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0798  CDS  NC_012880  906301  906672  372  protein of unknown function DUF488  YP_002986431  unclonable  1.64638e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0799  CDS  NC_012880  906656  907375  720  Opacity-associated protein A  YP_002986432  unclonable  4.09608e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0849  CDS  NC_012880  968134  970374  2241  GDP/GTP pyrophosphokinase  YP_002986481  unclonable  2.21192e-05  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1261  CDS  NC_012880  1439486  1442584  3099  beta-D-galactosidase  YP_002986885  unclonable  0.000337049  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1305  CDS  NC_012880  1493436  1494281  846  hypothetical protein  YP_002986929  unclonable  4.90747e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1491  CDS  NC_012880  1761729  1763882  2154  TonB-dependent siderophore receptor  YP_002987113  unclonable  3.6194e-05  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1588  CDS  NC_012880  1875847  1876083  237  acyl carrier protein  YP_002987209  unclonable  1.12562e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1662  CDS  NC_012880  1962681  1963664  984  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002987281  unclonable  1.34968e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1663  CDS  NC_012880  1963797  1964033  237  LPP repeat-containing protein  YP_002987282  unclonable  2.05201e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1664  CDS  NC_012880  1964349  1965758  1410  pyruvate kinase  YP_002987283  unclonable  4.86614e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1702  CDS  NC_012880  2023873  2025042  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_002987321  unclonable  4.18527e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_1719  CDS  NC_012880  2045431  2046984  1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_002987338  unclonable  7.12436e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2058  CDS  NC_012880  2437487  2438371  885  HtpX domain protein  YP_002987668  unclonable  4.52797e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2141  CDS  NC_012880  2527347  2528807  1461  hypothetical protein  YP_002987750  unclonable  2.8881e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2561  CDS  NC_012880  3006792  3007397  606  NUDIX hydrolase  YP_002988160  unclonable  6.30284e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2698  CDS  NC_012880  3153721  3154785  1065  outer membrane protein A  YP_002988297  unclonable  1.18487e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_2730  CDS  NC_012880  3191649  3193046  1398  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_002988329  unclonable  4.22836e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3018    NC_012880  3515948  3516022  75      unclonable  6.11461e-08  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3019  CDS  NC_012880  3516197  3516883  687  DNA mismatch repair protein  YP_002988615  unclonable  3.28639e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3188  CDS  NC_012880  3739944  3740900  957  cell division protein ZipA  YP_002988774  unclonable  1.14957e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3189  CDS  NC_012880  3741121  3741891  771  protein of unknown function DUF540  YP_002988775  unclonable  7.4726e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3352  CDS  NC_012880  3925606  3927570  1965  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_002988936  unclonable  8.88182e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3361  CDS  NC_012880  3934382  3935353  972  octaprenyl diphosphate synthase  YP_002988945  unclonable  7.77945e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3967  CDS  NC_012880  4597087  4599882  2796  DNA polymerase I  YP_002989542  unclonable  0.000137661  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_3968  CDS  NC_012880  4600261  4600884  624  periplasmic protein disulfide isomerase I  YP_002989543  unclonable  3.22053e-07  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_R0095  rRNA  NC_012880  4391637  4393167  1531  16S ribosomal RNA    unclonable  5.83009e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_R0100  rRNA  NC_012880  4607158  4608688  1531  16S ribosomal RNA    unclonable  4.86614e-06  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>