71 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Hneap_0295  CDS  NC_013422  305082  305684  603  hypothetical protein  YP_003262205  unclonable  5.5416e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0296  CDS  NC_013422  305666  306682  1017  aminoglycoside phosphotransferase  YP_003262206  unclonable  1.0357e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0297  CDS  NC_013422  306894  307613  720  Hydroxyacylglutathione hydrolase  YP_003262207  unclonable  3.96762e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0311  CDS  NC_013422  321454  321987  534  NusG antitermination factor  YP_003262221  unclonable  3.40936e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0318  CDS  NC_013422  333122  333499  378  ribosomal protein S12  YP_003262228  unclonable  2.92606e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0319  CDS  NC_013422  333527  333997  471  ribosomal protein S7  YP_003262229  unclonable  2.98761e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0320  CDS  NC_013422  334015  336114  2100  translation elongation factor G  YP_003262230  unclonable  4.39347e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0321  CDS  NC_013422  336147  337337  1191  translation elongation factor Tu  YP_003262231  unclonable  7.05932e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0322  CDS  NC_013422  337343  337654  312  ribosomal protein S10  YP_003262232  unclonable  1.45691e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0323  CDS  NC_013422  337802  338446  645  50S ribosomal protein L3  YP_003262233  unclonable  3.34047e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0324  CDS  NC_013422  338455  339063  609  ribosomal protein L4/L1e  YP_003262234  unclonable  3.30589e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0325  CDS  NC_013422  339060  339353  294  Ribosomal protein L25/L23  YP_003262235  unclonable  1.79883e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0326  CDS  NC_013422  339383  340207  825  ribosomal protein L2  YP_003262236  unclonable  4.80771e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0327  CDS  NC_013422  340232  340507  276  ribosomal protein S19  YP_003262237  unclonable  1.95023e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0328  CDS  NC_013422  340517  340849  333  ribosomal protein L22  YP_003262238  unclonable  2.46157e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0329  CDS  NC_013422  340860  341534  675  ribosomal protein S3  YP_003262239  unclonable  6.25588e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0330  CDS  NC_013422  341566  341979  414  ribosomal protein L16  YP_003262240  unclonable  4.39211e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0331  CDS  NC_013422  341979  342176  198  ribosomal protein L29  YP_003262241  unclonable  2.95668e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0332  CDS  NC_013422  342178  342447  270  30S ribosomal protein S17  YP_003262242  unclonable  3.51608e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0333  CDS  NC_013422  342460  342828  369  ribosomal protein L14  YP_003262243  unclonable  4.13124e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0334  CDS  NC_013422  342839  343162  324  ribosomal protein L24  YP_003262244  unclonable  3.66107e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0346  CDS  NC_013422  348702  349325  624  ribosomal protein S4  YP_003262256  unclonable  3.40936e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0391  CDS  NC_013422  405502  407439  1938  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_003262295  unclonable  3.88358e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0455  CDS  NC_013422  480248  481393  1146  cell division protein FtsZ  YP_003262359  unclonable  1.50066e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0475  CDS  NC_013422  498985  500775  1791  aspartyl-tRNA synthetase  YP_003262377  unclonable  6.26629e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0556  CDS  NC_013422  590651  591175  525  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  YP_003262457  unclonable  2.7249e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0557  CDS  NC_013422  591175  591831  657  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  YP_003262458  unclonable  3.11209e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0558  CDS  NC_013422  592036  592467  432  hypothetical protein  YP_003262459  unclonable  1.7104e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0559  CDS  NC_013422  592488  593195  708  hypothetical protein  YP_003262460  unclonable  3.07987e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0560  CDS  NC_013422  593331  594320  990  Rhodanese domain protein  YP_003262461  unclonable  5.8867e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0561  CDS  NC_013422  594473  595366  894  Phosphoribulokinase  YP_003262462  unclonable  6.38489e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0576  CDS  NC_013422  612638  614902  2265  catecholate siderophore receptor Fiu  YP_003262477  unclonable  7.14833e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0596  CDS  NC_013422  639959  641236  1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_003262496  unclonable  1.67725e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0638  CDS  NC_013422  689375  689944  570  hypothetical protein  YP_003262538  unclonable  2.64221e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0780  CDS  NC_013422  842110  843315  1206  protein of unknown function DUF214  YP_003262676  unclonable  1.78318e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1056  CDS  NC_013422  1141505  1142149  645  Peroxiredoxin  YP_003262939  unclonable  2.7249e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1162  CDS  NC_013422  1262885  1264432  1548  outer membrane efflux protein  YP_003263045  unclonable  1.99135e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1189  CDS  NC_013422  1295437  1297545  2109  TonB-dependent receptor  YP_003263072  unclonable  3.88358e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1299  CDS  NC_013422  1407248  1408462  1215  hypothetical protein  YP_003263181  unclonable  1.08925e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1331    NC_013422  1442505  1442624  120      unclonable  1.37096e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1630  CDS  NC_013422  1766800  1768263  1464  hypothetical protein  YP_003263505  unclonable  1.72977e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1756  CDS  NC_013422  1887667  1890717  3051  ribonuclease, Rne/Rng family  YP_003263626  unclonable  0.000532878  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1798  CDS  NC_013422  1933466  1934389  924  hypothetical protein  YP_003263668  unclonable  7.50515e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1859  CDS  NC_013422  1994121  1995125  1005  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  YP_003263728  unclonable  1.01477e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1904  CDS  NC_013422  2039394  2039771  378  hypothetical protein  YP_003263773  unclonable  2.31633e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1905  CDS  NC_013422  2039762  2039992  231  SirA family protein  YP_003263774  unclonable  1.95023e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1906  CDS  NC_013422  2039996  2040313  318  Rhodanese domain protein  YP_003263775  unclonable  2.36409e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1907  CDS  NC_013422  2041113  2041493  381  cytochrome c, class I  YP_003263776  unclonable  2.66985e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1908  CDS  NC_013422  2041537  2042442  906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  YP_003263777  unclonable  7.20789e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1944  CDS  NC_013422  2079276  2080307  1032  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  YP_003263813  unclonable  9.45772e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1968  CDS  NC_013422  2103619  2104335  717  cytochrome c class I  YP_003263837  unclonable  5.48419e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1969  CDS  NC_013422  2104505  2105362  858  dihydropteroate synthase  YP_003263838  unclonable  7.58372e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1970  CDS  NC_013422  2105370  2107340  1971  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_003263839  unclonable  7.29584e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_1984  CDS  NC_013422  2124017  2125120  1104  porin Gram-negative type  YP_003263853  unclonable  8.64013e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2003  CDS  NC_013422  2149951  2150298  348  ribosomal protein L19  YP_003263872  unclonable  2.53757e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2004  CDS  NC_013422  2150315  2151073  759  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  YP_003263873  unclonable  4.30338e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2019  CDS  NC_013422  2164317  2165879  1563  carbohydrate kinase, YjeF related protein  YP_003263888  unclonable  2.59128e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2020  CDS  NC_013422  2165889  2166899  1011  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_003263889  unclonable  7.13321e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2021  CDS  NC_013422  2167115  2167351  237  ribosomal protein L28  YP_003263890  unclonable  1.79883e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2022  CDS  NC_013422  2167404  2167559  156  ribosomal protein L33  YP_003263891  unclonable  1.44183e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2023  CDS  NC_013422  2167684  2168529  846  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_003263892  unclonable  5.8867e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2024  CDS  NC_013422  2168622  2168894  273  ribosomal protein S20  YP_003263893  unclonable  2.05272e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2025  CDS  NC_013422  2169063  2169692  630  trypsin  YP_003263894  unclonable  5.21243e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2026  CDS  NC_013422  2169947  2170684  738  orotate phosphoribosyltransferase  YP_003263895  unclonable  5.42739e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2027  CDS  NC_013422  2170746  2173328  2583  ATP-dependent chaperone ClpB  YP_003263896  unclonable  0.000180597  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2028  CDS  NC_013422  2173625  2174017  393  hypothetical protein  YP_003263897  unclonable  2.89576e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2044  CDS  NC_013422  2188716  2189144  429  ribosomal protein L13  YP_003263912  unclonable  5.10712e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2138  CDS  NC_013422  2296872  2298080  1209  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_003264002  unclonable  1.57826e-05  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2331  CDS  NC_013422  2502322  2503143  822  ATP synthase F0, A subunit  YP_003264188  unclonable  4.17448e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2350  CDS  NC_013422  2517655  2517867  213  hypothetical protein  YP_003264207  unclonable  1.95023e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_2351  CDS  NC_013422  2517928  2518257  330  transcriptional regulator, ArsR family  YP_003264208  unclonable  2.26954e-06  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>