33 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aazo_0001    NC_014248  96  1758  1663      unclonable  5.15989e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0002  CDS  NC_014248  2007  2231  225  hypothetical protein  YP_003719792  unclonable  5.14823e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0003  CDS  NC_014248  2814  2942  129  hypothetical protein  YP_003719793  unclonable  5.20094e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0004  CDS  NC_014248  3380  4228  849  hypothetical protein  YP_003719794  unclonable  2.24703e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0860  CDS  NC_014248  915579  916433  855  glutamate racemase  YP_003720398  unclonable  2.13664e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_0861  CDS  NC_014248  916581  918476  1896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_003720399  unclonable  1.95536e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1044  CDS  NC_014248  1114720  1114959  240  hypothetical protein  YP_003720529  unclonable  2.74038e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1045  CDS  NC_014248  1115515  1116576  1062  group 1 glycosyl transferase  YP_003720530  unclonable  1.51909e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_1480  CDS  NC_014248  1550512  1551495  984  RpoD subfamily RNA polymerase sigma 70 subunit  YP_003720816  unclonable  4.52918e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2050    NC_014248  2129746  2132094  2349      unclonable  1.5841e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_2051    NC_014248  2130069  2131613  1545      unclonable  3.93528e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3060  CDS  NC_014248  3151480  3152925  1446  glutamyl-tRNA synthetase  YP_003721949  unclonable  4.48328e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3775  CDS  NC_014248  3832699  3833247  549  hypothetical protein  YP_003722434  unclonable  6.35481e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3776  CDS  NC_014248  3833603  3834280  678  ABC transporter-like protein protein  YP_003722435  unclonable  1.14768e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3777  CDS  NC_014248  3834294  3834566  273  hypothetical protein  YP_003722436  unclonable  6.16585e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3778  CDS  NC_014248  3834890  3835945  1056  photosystem II D2 protein  YP_003722437  unclonable  1.6634e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3779  CDS  NC_014248  3836904  3838589  1686  carbohydrate-selective porin OprB  YP_003722438  unclonable  7.85609e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3846  CDS  NC_014248  3898161  3898409  249  hypothetical protein  YP_003722484  unclonable  1.12454e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3847    NC_014248  3898516  3898830  315      unclonable  1.41613e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3848  CDS  NC_014248  3899728  3900603  876  diacylglycerol kinase catalytic region  YP_003722485  unclonable  4.1794e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_3903  CDS  NC_014248  3956570  3957448  879  hypothetical protein  YP_003722530  unclonable  2.80049e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4421  CDS  NC_014248  4501661  4502476  816  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_003722852  unclonable  1.64624e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4422  CDS  NC_014248  4502566  4503159  594  hypothetical protein  YP_003722853  unclonable  1.12454e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4505  CDS  NC_014248  4597789  4598007  219  hypothetical protein  YP_003722906  unclonable  8.08004e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4610  CDS  NC_014248  4715834  4718200  2367  peptidase M23  YP_003722973  unclonable  1.63265e-05  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4838  CDS  NC_014248  4949253  4950527  1275  S-adenosylmethionine synthetase  YP_003723114  unclonable  2.20213e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4839  CDS  NC_014248  4950720  4951721  1002  Phosphoribulokinase  YP_003723115  unclonable  1.56566e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4962  CDS  NC_014248  5081591  5082463  873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003723213  unclonable  1.87582e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_4978  CDS  NC_014248  5098972  5099466  495  photosystem I reaction center protein PsaF subunit III  YP_003723225  unclonable  1.64624e-06  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0040  tRNA  NC_014248  3153047  3153120  74  tRNA-Asp    unclonable  3.89023e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0045  tRNA  NC_014248  3832449  3832520  72  tRNA-Asn    unclonable  3.1214e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0046  tRNA  NC_014248  3898971  3899056  86  tRNA-Tyr    unclonable  8.58289e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Aazo_R0047  tRNA  NC_014248  3899145  3899216  72  tRNA-Thr    unclonable  8.41137e-07  n/a    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>