66 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
EcDH1_0298  CDS  CP001637  335889  337205  1317  gluconate transporter  ACX37988  unclonable  2.70945e-14  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0371  CDS  CP001637  409212  409586  375  ribosomal protein S12  ACX38061  unclonable  1.72822e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0634  CDS  CP001637  670912  672657  1746  DNA primase  ACX38321  unclonable  2.61356e-13  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0635  CDS  CP001637  672768  672983  216  ribosomal protein S21  ACX38322  unclonable  4.12914e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0645  CDS  CP001637  681936  682556  621  SH3 domain protein  ACX38331  unclonable  2.8262e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0782  CDS  CP001637  827822  828151  330  protein of unknown function DUF710  ACX38466  unclonable  5.86222e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0801  CDS  CP001637  847481  848579  1099  hypothetical protein  ACX38485  unclonable  6.91536e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_0904  CDS  CP001637  970112  972346  2235  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  ACX38587  unclonable  6.60798e-12  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1080  CDS  CP001637  1149589  1152162  2574  ATP-dependent chaperone ClpB  ACX38754  unclonable  1.45981e-11  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1247  CDS  CP001637  1343592  1344563  972  cysteine synthase A  ACX38921  unclonable  4.02338e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1248  CDS  CP001637  1344748  1345509  762  protein of unknown function DUF540  ACX38922  unclonable  1.24469e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1249  CDS  CP001637  1345739  1346725  987  cell division protein ZipA  ACX38923  unclonable  4.96931e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1357  CDS  CP001637  1457796  1458338  543  NUDIX hydrolase  ACX39029  unclonable  2.43085e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1734  CDS  CP001637  1885238  1885786  549  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  ACX39393  unclonable  1.72822e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_1992  CDS  CP001637  2152558  2152797  240  protein of unknown function DUF1289  ACX39649  unclonable  3.11931e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2103  CDS  CP001637  2247565  2249025  1461  Mannitol dehydrogenase domain protein  ACX39758  unclonable  1.35615e-14  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2104  CDS  CP001637  2249060  2249263  204  selenium-binding protein YdfZ  ACX39759  unclonable  7.75874e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2105  CDS  CP001637  2249440  2250126  687  transcriptional regulator, GntR family  ACX39760  unclonable  1.45704e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2367  CDS  CP001637  2537950  2539119  1170  Tetratricopeptide domain protein  ACX40010  unclonable  6.51113e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2368  CDS  CP001637  2539126  2539434  309  protein of unknown function DUF1049  ACX40011  unclonable  6.48025e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2463  CDS  CP001637  2645448  2645978  531  Disulphide bond formation protein DsbB  ACX40103  unclonable  2.15548e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2554  CDS  CP001637  2728335  2729069  735  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  ACX40190  unclonable  9.3114e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2555  CDS  CP001637  2729082  2730011  930  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  ACX40191  unclonable  2.13836e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2556  CDS  CP001637  2730027  2730980  954  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  ACX40192  unclonable  2.31699e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2557  CDS  CP001637  2731048  2732088  1041  fatty acid/phospholipid synthesis protein PlsX  ACX40193  unclonable  3.9428e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2558  CDS  CP001637  2732199  2732372  174  ribosomal protein L32  ACX40194  unclonable  3.21504e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2559  CDS  CP001637  2732424  2732945  522  protein of unknown function DUF177  ACX40195  unclonable  1.87302e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2686  CDS  CP001637  2861066  2862106  1041  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  ACX40319  unclonable  9.93272e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2687  CDS  CP001637  2862182  2862634  453  protein of unknown function DUF1047  ACX40320  unclonable  2.43085e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2688  CDS  CP001637  2862820  2864580  1761  putative ATP-dependent protease  ACX40321  unclonable  2.56121e-13  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2689  CDS  CP001637  2864541  2865167  627  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA  ACX40322  unclonable  3.00166e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2713  CDS  CP001637  2892134  2893534  1401  asparaginyl-tRNA synthetase  ACX40346  unclonable  7.15906e-14  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2877  CDS  CP001637  3083507  3084565  1059  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  ACX40510  unclonable  2.07468e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2893  CDS  CP001637  3100730  3101521  792  tol-pal system protein YbgF  ACX40526  unclonable  7.77215e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2894  CDS  CP001637  3101531  3102052  522  peptidoglycan-associated lipoprotein  ACX40527  unclonable  1.67676e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2895  CDS  CP001637  3102087  3103379  1293  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  ACX40528  unclonable  2.3315e-14  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2950  CDS  CP001637  3167587  3168132  546  SeqA family protein  ACX40579  unclonable  2.58236e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2951  CDS  CP001637  3168317  3169081  765  alpha/beta hydrolase fold protein  ACX40580  unclonable  1.61502e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_2989  CDS  CP001637  3212083  3212400  318  iojap-like protein  ACX40618  unclonable  4.79848e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3171  CDS  CP001637  3412255  3413529  1275  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpX  ACX40797  unclonable  1.03405e-14  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3172  CDS  CP001637  3413655  3414278  624  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  ACX40798  unclonable  1.64318e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3173  CDS  CP001637  3414524  3415822  1299  trigger factor  ACX40799  unclonable  6.98649e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3262  CDS  CP001637  3504650  3507724  3075  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  ACX40886  unclonable  8.77394e-10  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3423    CP001637  3668822  3669276  455      unclonable  1.87302e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3424  CDS  CP001637  3669381  3670406  1026  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl) glucosamine N-acyltransferase  ACX41039  unclonable  3.86383e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3504  CDS  CP001637  3763903  3764820  918  UDP-3-0-acyl N-acetylglucosamine deacetylase  ACX41119  unclonable  1.99287e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3505  CDS  CP001637  3764921  3766072  1152  cell division protein FtsZ  ACX41120  unclonable  9.63693e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3544  CDS  CP001637  3813198  3814013  816  heat shock protein DnaJ domain protein  ACX41158  unclonable  3.15628e-16  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_3545  CDS  CP001637  3814268  3816622  2355  Organic solvent tolerance protein  ACX41159  unclonable  2.67581e-12  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_4015  CDS  CP001637  4337342  4338526  1185  translation elongation factor Tu  ACX41615  unclonable  7.05833e-15  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_4180  CDS  CP001637  4532198  4533583  1386  amino acid permease-associated region  ACX41780  unclonable  1.15482e-14  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0020  tRNA  CP001637  1065118  1065210  93  tRNA-Ser    unclonable  2.35698e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0044  tRNA  CP001637  1885938  1886013  76  tRNA-Gly    unclonable  1.35893e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0060  tRNA  CP001637  3100490  3100565  76  tRNA-Lys    unclonable  1.42893e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0061  tRNA  CP001637  3183986  3184062  77  tRNA-Met    unclonable  4.99234e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0062  tRNA  CP001637  3184072  3184156  85  tRNA-Leu    unclonable  4.89236e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0063  tRNA  CP001637  3184180  3184254  75  tRNA-Gln    unclonable  4.51209e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0064  tRNA  CP001637  3184289  3184363  75  tRNA-Gln    unclonable  4.7933e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0065  tRNA  CP001637  3184379  3184455  77  tRNA-Met    unclonable  4.7933e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0066  tRNA  CP001637  3184503  3184577  75  tRNA-Gln    unclonable  4.69731e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0083  tRNA  CP001637  4121923  4121998  76  tRNA-Gly    unclonable  7.37865e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0084  tRNA  CP001637  4122034  4122109  76  tRNA-Gly    unclonable  6.41323e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0085  tRNA  CP001637  4122146  4122221  76  tRNA-Gly    unclonable  5.68672e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0091  tRNA  CP001637  4338641  4338716  76  tRNA-Thr    unclonable  2.13219e-17  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0107  tRNA  CP001637  4532019  4532095  77  tRNA-Arg    unclonable  9.38441e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
EcDH1_R0114  tRNA  CP001637  3184614  3184689  76  tRNA-Gln    unclonable  4.1228e-18  n/a    Escherichia coli DH1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>