48 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mesil_0006  CDS  NC_014212  8736  9893  -  1158  Integrase catalytic region  YP_003683462  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0107  CDS  NC_014212  110664  113423  +  2760  S-layer domain protein  YP_003683560  unclonable  0.0000309483  normal  1  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0574  CDS  NC_014212  561497  561802  +  306  putative oxidoreductase  YP_003684011  normal  0.0599472  unclonable  0.00000228305  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0575  CDS  NC_014212  561854  563464  -  1611  UvrD/REP helicase  YP_003684012  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0576  CDS  NC_014212  563532  564170  +  639  Excalibur domain protein  YP_003684013  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0577  CDS  NC_014212  564160  564435  +  276  Spnb5; cytoskeletal protein beta 5  YP_003684014  decreased coverage  0.000000655872  unclonable  0.0000023775  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0578    NC_014212  564445  564690  -  246      decreased coverage  0.000000619553  unclonable  0.00000235321  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0579    NC_014212  564921  565376  +  456      hitchhiker  0.00000820232  unclonable  0.00000279378  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0580  CDS  NC_014212  565516  565848  +  333  hypothetical protein  YP_003684015  hitchhiker  0.000184172  unclonable  0.00000306018  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0581  CDS  NC_014212  565892  567067  +  1176  SagB-type dehydrogenase domain protein  YP_003684016  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0582  CDS  NC_014212  567069  568001  +  933  ABC transporter related protein  YP_003684017  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0583  CDS  NC_014212  567952  568692  +  741  ABC-2 type transporter  YP_003684018  normal  1  unclonable  0.00000328472  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0710  CDS  NC_014212  699167  700375  +  1209  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  YP_003684133  unclonable  0.000000582487  normal  0.0172395  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0749  CDS  NC_014212  739410  739715  +  306  ribosomal protein L21  YP_003684170  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0750  CDS  NC_014212  739787  740059  +  273  ribosomal protein L27  YP_003684171  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1072  CDS  NC_014212  1063844  1064050  +  207  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_003684485  unclonable  0.0000000253624  normal  1  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1229  CDS  NC_014212  1213957  1214358  +  402  hypothetical protein  YP_003684634  unclonable  0.0000000511422  normal  0.638176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1230  CDS  NC_014212  1214412  1216097  +  1686  CRISPR-associated protein, Cse1 family  YP_003684635  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1473  CDS  NC_014212  1472473  1474212  -  1740  translation initiation factor IF-2  YP_003684873  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1474  CDS  NC_014212  1474277  1474582  -  306  protein of unknown function DUF448  YP_003684874  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1475  CDS  NC_014212  1474674  1475855  -  1182  transcription termination factor NusA  YP_003684875  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1476  CDS  NC_014212  1475955  1476386  -  432  protein of unknown function DUF150  YP_003684876  decreased coverage  0.0000465706  unclonable  0.0000025252  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1477  CDS  NC_014212  1476527  1477363  -  837  transcriptional regulator, AraC family  YP_003684877  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1478  CDS  NC_014212  1477408  1478232  -  825  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_003684878  hitchhiker  0.00203785  unclonable  0.00000282261  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_2280  CDS  NC_014212  2311998  2312597  +  600  protein of unknown function DUF305  YP_003685654  unclonable  0.000000158404  normal  1  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_2474  CDS  NC_014212  2513288  2515705  +  2418  DNA gyrase, A subunit  YP_003685835  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_2677  CDS  NC_014212  2718171  2719286  -  1116  Integrase catalytic region  YP_003686032  unclonable  0.000000537558  normal  1  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3074  CDS  NC_014212  3119476  3121341  -  1866  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003686416  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3198    NC_014213  6  413  +  408      decreased coverage  0.0000000325325  unclonable  0.00000335198  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3199  CDS  NC_014213  416  856  +  441  hypothetical protein  YP_003686529  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3200  CDS  NC_014213  853  1707  +  855  translation initiation factor IF-2  YP_003686530  hitchhiker  0.0000121802  unclonable  0.00000453571  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3201  CDS  NC_014213  1718  3013  +  1296  hypothetical protein  YP_003686531  hitchhiker  0.000763805  unclonable  0.00000506587  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3202  CDS  NC_014213  3023  4309  +  1287  LigA protein  YP_003686532  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3525    NC_014213  341937  342101  +  165      hitchhiker  0.00485468  unclonable  0.00000296813  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3526  CDS  NC_014213  342449  342706  +  258  hypothetical protein  YP_003686833  hitchhiker  0.000345373  unclonable  0.00000321794  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3527    NC_014213  342742  343262  +  521      hitchhiker  0.000159112  unclonable  0.00000352479  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3528  CDS  NC_014213  343455  344264  +  810  hypothetical protein  YP_003686834  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3529    NC_014213  344302  344475  +  174      hitchhiker  0.000000674432  unclonable  0.00000265609  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3530    NC_014213  344480  345779  -  1300      hitchhiker  0.0000207642  unclonable  0.00000363508  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3531    NC_014213  346184  347308  +  1125      decreased coverage  0.000000175453  unclonable  0.00000440048  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3545  CDS  NC_014214  9234  9746  -  513  RAD52/22 double-strand break repair protein  YP_003686846  unclonable  0.00000561994  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3546  CDS  NC_014214  9810  10106  -  297  hypothetical protein  YP_003686847  unclonable  0.0000049335  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3547  CDS  NC_014214  10100  10315  -  216  hypothetical protein  YP_003686848  unclonable  0.00000459622  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3548  CDS  NC_014214  10275  10466  -  192  hypothetical protein  YP_003686849  unclonable  0.00000454802  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3549  CDS  NC_014214  10711  10923  +  213  transcriptional regulator, XRE family  YP_003686850  unclonable  0.00000469163  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3582  CDS  NC_014214  35376  36860  +  1485  hypothetical protein  YP_003686880  unclonable  0.0000410159  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3611  CDS  NC_014214  68455  68961  +  507  hypothetical protein  YP_003686909  unclonable  0.00000633991  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_R0016  tRNA  NC_014212  700433  700509  -  77  tRNA-Pro    unclonable  0.0000000335758  normal  0.0133368  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>