48 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mesil_0006  CDS  NC_014212  8736  9893  1158  Integrase catalytic region  YP_003683462  unclonable  3.97696e-07  normal  0.219937  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0107  CDS  NC_014212  110664  113423  2760  S-layer domain protein  YP_003683560  unclonable  3.09483e-05  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0574  CDS  NC_014212  561497  561802  306  putative oxidoreductase  YP_003684011  normal  0.0599472  unclonable  2.28305e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0575  CDS  NC_014212  561854  563464  1611  UvrD/REP helicase  YP_003684012  hitchhiker  0.000167989  unclonable  3.59794e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0576  CDS  NC_014212  563532  564170  639  Excalibur domain protein  YP_003684013  unclonable  1.2089e-07  unclonable  2.55125e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0577  CDS  NC_014212  564160  564435  276  Spnb5; cytoskeletal protein beta 5  YP_003684014  decreased coverage  6.55872e-07  unclonable  2.3775e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0578    NC_014212  564445  564690  246      decreased coverage  6.19553e-07  unclonable  2.35321e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0579    NC_014212  564921  565376  456      hitchhiker  8.20232e-06  unclonable  2.79378e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0580  CDS  NC_014212  565516  565848  333  hypothetical protein  YP_003684015  hitchhiker  0.000184172  unclonable  3.06018e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0581  CDS  NC_014212  565892  567067  1176  SagB-type dehydrogenase domain protein  YP_003684016  hitchhiker  0.00313283  unclonable  4.22679e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0582  CDS  NC_014212  567069  568001  933  ABC transporter related protein  YP_003684017  normal  0.691368  unclonable  3.97849e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0583  CDS  NC_014212  567952  568692  741  ABC-2 type transporter  YP_003684018  normal  unclonable  3.28472e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0710  CDS  NC_014212  699167  700375  1209  CRISPR-associated protein, TIGR02710 family  YP_003684133  unclonable  5.82487e-07  normal  0.0172395  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0749  CDS  NC_014212  739410  739715  306  ribosomal protein L21  YP_003684170  unclonable  4.86349e-08  hitchhiker  0.00474582  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_0750  CDS  NC_014212  739787  740059  273  ribosomal protein L27  YP_003684171  unclonable  3.902e-08  hitchhiker  0.00471075  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1072  CDS  NC_014212  1063844  1064050  207  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_003684485  unclonable  2.53624e-08  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1229  CDS  NC_014212  1213957  1214358  402  hypothetical protein  YP_003684634  unclonable  5.11422e-08  normal  0.638176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1230  CDS  NC_014212  1214412  1216097  1686  CRISPR-associated protein, Cse1 family  YP_003684635  unclonable  2.14368e-06  normal  0.502097  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1473  CDS  NC_014212  1472473  1474212  1740  translation initiation factor IF-2  YP_003684873  normal  0.147864  unclonable  4.76955e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1474  CDS  NC_014212  1474277  1474582  306  protein of unknown function DUF448  YP_003684874  hitchhiker  0.00145328  unclonable  2.73772e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1475  CDS  NC_014212  1474674  1475855  1182  transcription termination factor NusA  YP_003684875  decreased coverage  4.77736e-05  unclonable  3.25116e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1476  CDS  NC_014212  1475955  1476386  432  protein of unknown function DUF150  YP_003684876  decreased coverage  4.65706e-05  unclonable  2.5252e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1477  CDS  NC_014212  1476527  1477363  837  transcriptional regulator, AraC family  YP_003684877  decreased coverage  0.000537918  unclonable  2.96813e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_1478  CDS  NC_014212  1477408  1478232  825  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_003684878  hitchhiker  0.00203785  unclonable  2.82261e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_2280  CDS  NC_014212  2311998  2312597  600  protein of unknown function DUF305  YP_003685654  unclonable  1.58404e-07  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_2474  CDS  NC_014212  2513288  2515705  2418  DNA gyrase, A subunit  YP_003685835  unclonable  1.72995e-05  decreased coverage  0.00702489  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_2677  CDS  NC_014212  2718171  2719286  1116  Integrase catalytic region  YP_003686032  unclonable  5.37558e-07  normal  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3074  CDS  NC_014212  3119476  3121341  1866  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003686416  unclonable  1.49398e-06  normal  0.300897  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3198    NC_014213  413  408      decreased coverage  3.25325e-08  unclonable  3.35198e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3199  CDS  NC_014213  416  856  441  hypothetical protein  YP_003686529  hitchhiker  5.04945e-07  unclonable  3.52479e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3200  CDS  NC_014213  853  1707  855  translation initiation factor IF-2  YP_003686530  hitchhiker  1.21802e-05  unclonable  4.53571e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3201  CDS  NC_014213  1718  3013  1296  hypothetical protein  YP_003686531  hitchhiker  0.000763805  unclonable  5.06587e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3202  CDS  NC_014213  3023  4309  1287  LigA protein  YP_003686532  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3525    NC_014213  341937  342101  165      hitchhiker  0.00485468  unclonable  2.96813e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3526  CDS  NC_014213  342449  342706  258  hypothetical protein  YP_003686833  hitchhiker  0.000345373  unclonable  3.21794e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3527    NC_014213  342742  343262  521      hitchhiker  0.000159112  unclonable  3.52479e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3528  CDS  NC_014213  343455  344264  810  hypothetical protein  YP_003686834  hitchhiker  1.91254e-05  unclonable  3.97849e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3529    NC_014213  344302  344475  174      hitchhiker  6.74432e-07  unclonable  2.65609e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3530    NC_014213  344480  345779  1300      hitchhiker  2.07642e-05  unclonable  3.63508e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3531    NC_014213  346184  347308  1125      decreased coverage  1.75453e-07  unclonable  4.40048e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3545  CDS  NC_014214  9234  9746  513  RAD52/22 double-strand break repair protein  YP_003686846  unclonable  5.61994e-06  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3546  CDS  NC_014214  9810  10106  297  hypothetical protein  YP_003686847  unclonable  4.9335e-06  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3547  CDS  NC_014214  10100  10315  216  hypothetical protein  YP_003686848  unclonable  4.59622e-06  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3548  CDS  NC_014214  10275  10466  192  hypothetical protein  YP_003686849  unclonable  4.54802e-06  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3549  CDS  NC_014214  10711  10923  213  transcriptional regulator, XRE family  YP_003686850  unclonable  4.69163e-06  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3582  CDS  NC_014214  35376  36860  1485  hypothetical protein  YP_003686880  unclonable  4.10159e-05  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_3611  CDS  NC_014214  68455  68961  507  hypothetical protein  YP_003686909  unclonable  6.33991e-06  n/a    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Mesil_R0016  tRNA  NC_014212  700433  700509  77  tRNA-Pro    unclonable  3.35758e-08  normal  0.0133368  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>