62 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bmur_0099  CDS  NC_014150  120390  121082  693  Ankyrin  YP_003632408  unclonable  1.52071e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0140  CDS  NC_014150  171686  174289  2604  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  YP_003632446  unclonable  7.0838e-16  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0186  CDS  NC_014150  250666  251454  789  flagellar biosynthetic protein FliP  YP_003632492  unclonable  1.14334e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0197  CDS  NC_014150  268017  268745  729  hypothetical protein  YP_003632503  unclonable  2.07773e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0357  CDS  NC_014150  450954  453056  2103  NHL repeat containing protein  YP_003632660  unclonable  3.18335e-18  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0492  CDS  NC_014150  602379  603083  705  hypothetical protein  YP_003632794  unclonable  9.97788e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0504  CDS  NC_014150  619120  619896  777  hypothetical protein  YP_003632806  unclonable  3.99113e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0541  CDS  NC_014150  661645  662856  1212  sodium:dicarboxylate symporter  YP_003632843  unclonable  2.74515e-21  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0542  CDS  NC_014150  662838  663359  522  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003632844  unclonable  3.2131e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0543    NC_014150  663377  663592  216      unclonable  2.62835e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0544    NC_014150  663589  663789  201      unclonable  1.70858e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0545  CDS  NC_014150  663816  664163  348  nitrogen regulatory protein PII  YP_003632845  unclonable  8.30947e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0546  CDS  NC_014150  664240  665079  840  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  YP_003632846  unclonable  4.54841e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0547  CDS  NC_014150  665121  665702  582  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  YP_003632847  unclonable  3.77192e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0548  CDS  NC_014150  665695  666354  660  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  YP_003632848  unclonable  7.61425e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0560  CDS  NC_014150  680406  680741  336  hypothetical protein  YP_003632860  unclonable  1.8331e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0609  CDS  NC_014150  732820  734058  1239  Peptidase M23  YP_003632909  unclonable  1.01787e-21  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0675  CDS  NC_014150  807928  808614  687  hypothetical protein  YP_003632974  unclonable  1.86e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0676  CDS  NC_014150  808905  809597  693  hypothetical protein  YP_003632975  unclonable  3.87182e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0741  CDS  NC_014150  885995  886804  810  hypothetical protein  YP_003633039  unclonable  2.8368e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0742  CDS  NC_014150  887057  888037  981  hypothetical protein  YP_003633040  unclonable  1.44052e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0743  CDS  NC_014150  888021  889328  1308  OstA family protein  YP_003633041  unclonable  3.82384e-21  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0744  CDS  NC_014150  889348  889914  567  protein of unknown function DUF1239  YP_003633042  unclonable  3.88815e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0745  CDS  NC_014150  889892  890443  552  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase, YrbI family  YP_003633043  unclonable  4.70502e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0746  CDS  NC_014150  890737  891480  744  tRNA pseudouridine synthase A  YP_003633044  unclonable  3.57289e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0747  CDS  NC_014150  891547  892506  960  protein of unknown function DUF534  YP_003633045  unclonable  2.99763e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_0857  CDS  NC_014150  1016365  1017222  858  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_003633155  unclonable  4.28203e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1004  CDS  NC_014150  1172460  1173296  837  flagellar filament outer layer protein FlaA  YP_003633299  unclonable  8.21104e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1026  CDS  NC_014150  1203916  1207731  3816  hypothetical protein  YP_003633321  unclonable  3.37819e-11  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1053  CDS  NC_014150  1236442  1237830  1389  MATE efflux family protein  YP_003633348  unclonable  1.21151e-20  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1091  CDS  NC_014150  1284568  1285923  1356  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  YP_003633385  unclonable  4.18691e-21  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1106  CDS  NC_014150  1298141  1298605  465  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  YP_003633400  unclonable  1.22772e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1156  CDS  NC_014150  1354733  1356877  2145  hypothetical protein  YP_003633449  unclonable  1.16492e-17  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1264  CDS  NC_014150  1468955  1469068  114  hypothetical protein  YP_003633556  unclonable  1.30385e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1265  CDS  NC_014150  1469298  1469561  264  ribosomal protein S20  YP_003633557  unclonable  6.15154e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1610  CDS  NC_014150  1849512  1850642  1131  serpulina hyodysenteriae variable surface protein  YP_003633895  unclonable  5.52084e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1611  CDS  NC_014150  1851034  1851990  957  hypothetical protein  YP_003633896  unclonable  1.5466e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1612  CDS  NC_014150  1852077  1852628  552  hypothetical protein  YP_003633897  unclonable  1.98752e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1785  CDS  NC_014150  2037080  2038390  1311  Xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_003634066  unclonable  2.31517e-21  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1786  CDS  NC_014150  2038807  2039259  453  hypothetical protein  YP_003634067  unclonable  1.26554e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1787  CDS  NC_014150  2039796  2040947  1152  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferas e  YP_003634068  unclonable  6.95343e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1797  CDS  NC_014150  2053622  2054473  852  hypothetical protein  YP_003634078  unclonable  1.63269e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1901  CDS  NC_014150  2164410  2165321  912  hypothetical protein  YP_003634179  unclonable  3.50092e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1987  CDS  NC_014150  2263507  2264103  597  Superoxide dismutase  YP_003634264  unclonable  1.45623e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_1988  CDS  NC_014150  2264273  2265313  1041  hypothetical protein  YP_003634265  unclonable  1.5466e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2191  CDS  NC_014150  2492350  2493135  786  hypothetical protein  YP_003634464  unclonable  2.4636e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2202  CDS  NC_014150  2501299  2502024  726  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  YP_003634475  unclonable  1.58388e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2309  CDS  NC_014150  2612255  2612935  681  hypothetical protein  YP_003634581  unclonable  1.95604e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2310  CDS  NC_014150  2613025  2613657  633  hypothetical protein  YP_003634582  unclonable  1.47525e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2353  CDS  NC_014150  2660258  2661118  861  extracellular solute-binding protein family 3  YP_003634624  unclonable  1.09811e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2500  CDS  NC_014150  2825917  2826636  720  hypothetical protein  YP_003634768  unclonable  1.23138e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2519  CDS  NC_014150  2846228  2848069  1842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003634787  unclonable  4.28482e-19  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2575  CDS  NC_014150  2910554  2911591  1038  serpulina hyodysenteriae variable surface protein  YP_003634843  unclonable  2.87908e-22  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2576  CDS  NC_014150  2911769  2912602  834  hypothetical protein  YP_003634844  unclonable  2.72365e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2577  CDS  NC_014150  2912819  2913574  756  hypothetical protein  YP_003634845  unclonable  1.52071e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2635  CDS  NC_014150  2984145  2985971  1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003634903  unclonable  9.45826e-19  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2662  CDS  NC_014150  3022114  3022431  318  thioredoxin  YP_003634929  unclonable  6.93824e-25  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2663  CDS  NC_014150  3022611  3023027  417  transcriptional regulator, MarR family  YP_003634930  unclonable  1.65897e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2777  CDS  NC_014150  3155846  3156556  711  hypothetical protein  YP_003635043  unclonable  1.34781e-23  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_2824  CDS  NC_014150  3211317  3211895  579  translation initiation factor IF-3  YP_003635090  unclonable  5.30858e-24  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_R0011  tRNA  NC_014150  890485  890557  73  tRNA-Arg    unclonable  6.87033e-26  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Bmur_R0012  tRNA  NC_014150  890590  890672  83  tRNA-Ser    unclonable  8.82473e-26  n/a    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>