231 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sterm_0022  CDS  NC_013517  27446  27913  468  protein of unknown function DUF163  YP_003306841  unclonable  1.20768e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0043  CDS  NC_013517  51123  51767  645  hypothetical protein  YP_003306862  unclonable  2.15417e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0080  CDS  NC_013517  84024  84815  792  ribosomal protein S2  YP_003306896  unclonable  1.55744e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0090  CDS  NC_013517  97159  100113  2955  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003306906  unclonable  1.65147e-06  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0091  CDS  NC_013517  100123  101043  921  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_003306907  unclonable  8.78302e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0092  CDS  NC_013517  101366  102703  1338  hypothetical protein  YP_003306908  unclonable  2.78192e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0093  CDS  NC_013517  102709  102957  249  RNA-binding S4 domain protein  YP_003306909  unclonable  4.15805e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0094  CDS  NC_013517  102954  103811  858  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_003306910  unclonable  4.49957e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0095  CDS  NC_013517  104012  104311  300  SpoVG family protein  YP_003306911  unclonable  5.35808e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0096  CDS  NC_013517  104480  105043  564  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_003306912  unclonable  1.43526e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0097  CDS  NC_013517  105127  105699  573  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_003306913  unclonable  1.2965e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0226  CDS  NC_013517  236691  237161  471  transcriptional regulator, MarR family  YP_003307042  unclonable  2.77932e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0256  CDS  NC_013517  281449  282087  639  hypothetical protein  YP_003307072  unclonable  3.50084e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0285  CDS  NC_013517  315326  315856  531  hypothetical protein  YP_003307100  unclonable  1.00535e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0286  CDS  NC_013517  316287  318629  2343  hypothetical protein  YP_003307101  unclonable  9.87796e-08  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0287  CDS  NC_013517  318610  319161  552  hypothetical protein  YP_003307102  unclonable  1.28328e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0295  CDS  NC_013517  325726  326199  474  protein of unknown function DUF336  YP_003307110  unclonable  1.14767e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0296  CDS  NC_013517  326347  326472  126  hypothetical protein  YP_003307111  unclonable  4.50971e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0297  CDS  NC_013517  326526  327602  1077  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_003307112  unclonable  1.76326e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0298  CDS  NC_013517  327721  328101  381  hypothetical protein  YP_003307113  unclonable  1.10187e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0299  CDS  NC_013517  328194  329426  1233  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  YP_003307114  unclonable  4.26165e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0300  CDS  NC_013517  329427  329981  555  transcriptional regulator, TetR family  YP_003307115  unclonable  1.86865e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0301  CDS  NC_013517  330175  330969  795  Beta-lactamase  YP_003307116  unclonable  2.9774e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0302  CDS  NC_013517  331244  331594  351  ribosomal protein L19  YP_003307117  unclonable  3.99217e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0442  CDS  NC_013517  490656  491450  795  hypothetical protein  YP_003307253  unclonable  4.73373e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0443  CDS  NC_013517  491467  492429  963  hypothetical protein  YP_003307254  unclonable  6.55262e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0606  CDS  NC_013517  655915  657126  1212  uracil-xanthine permease  YP_003307410  unclonable  1.6937e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0627  CDS  NC_013517  680887  681312  426  hypothetical protein  YP_003307431  unclonable  3.99217e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0628  CDS  NC_013517  681347  681730  384  hypothetical protein  YP_003307432  unclonable  4.24406e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0629  CDS  NC_013517  681841  682689  849  hypothetical protein  YP_003307433  unclonable  2.66466e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0630  CDS  NC_013517  682847  683056  210  hypothetical protein  YP_003307434  unclonable  1.38912e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0631  CDS  NC_013517  683066  683356  291  hypothetical protein  YP_003307435  unclonable  1.55138e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0632  CDS  NC_013517  683369  683638  270  hypothetical protein  YP_003307436  unclonable  1.66465e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0633  CDS  NC_013517  683855  684307  453  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  YP_003307437  unclonable  4.8911e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0634  CDS  NC_013517  684380  684940  561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003307438  unclonable  5.63815e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0635  CDS  NC_013517  685073  685903  831  PP-loop domain protein  YP_003307439  unclonable  2.08948e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0636  CDS  NC_013517  686221  686436  216  FeoA family protein  YP_003307440  unclonable  2.56503e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0637  CDS  NC_013517  686438  688657  2220  ferrous iron transport protein B  YP_003307441  unclonable  7.36261e-08  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0645    NC_013517  694419  695607  1189      unclonable  1.47061e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0646  CDS  NC_013517  695704  696723  1020  hypothetical protein  YP_003307449  unclonable  5.97249e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0647  CDS  NC_013517  697766  698086  321  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  YP_003307450  unclonable  3.3306e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0667  CDS  NC_013517  718581  719117  537  hypothetical protein  YP_003307470  unclonable  1.20768e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0683  CDS  NC_013517  735766  736260  495  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_003307486  unclonable  6.30574e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0684  CDS  NC_013517  736390  736764  375  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  YP_003307487  unclonable  4.33082e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0685  CDS  NC_013517  736959  737420  462  hypothetical protein  YP_003307488  unclonable  7.65075e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0686  CDS  NC_013517  737420  737794  375  hypothetical protein  YP_003307489  unclonable  5.41321e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0687  CDS  NC_013517  738011  738928  918  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  YP_003307490  unclonable  2.15417e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0847  CDS  NC_013517  905087  905719  633  hypothetical protein  YP_003307650  unclonable  1.60526e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0848  CDS  NC_013517  905755  906243  489  hypothetical protein  YP_003307651  unclonable  9.46347e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0849  CDS  NC_013517  906926  907060  135  hypothetical protein  YP_003307652  unclonable  2.46329e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0885  CDS  NC_013517  933060  933578  519  hypothetical protein  YP_003307687  unclonable  6.30574e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0886    NC_013517  933669  935000  1332      unclonable  1.30301e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0887  CDS  NC_013517  935077  935478  402  hypothetical protein  YP_003307688  unclonable  4.84129e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0888  CDS  NC_013517  935417  935941  525  hypothetical protein  YP_003307689  unclonable  7.26893e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0889  CDS  NC_013517  936038  936223  186  hypothetical protein  YP_003307690  unclonable  2.95259e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0890  CDS  NC_013517  936181  936414  234  hypothetical protein  YP_003307691  unclonable  3.43284e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0891  CDS  NC_013517  936490  936717  228  hypothetical protein  YP_003307692  unclonable  2.20462e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0892  CDS  NC_013517  936816  937808  993  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003307693  unclonable  5.56598e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0893  CDS  NC_013517  937862  938593  732  hypothetical protein  YP_003307694  unclonable  2.36104e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0894  CDS  NC_013517  938687  939322  636  hypothetical protein  YP_003307695  unclonable  2.2896e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0907  CDS  NC_013517  956185  958881  2697  calcium-translocating P-type ATPase, PMCA-type  YP_003307706  unclonable  6.23428e-07  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0918  CDS  NC_013517  969675  970226  552  hypothetical protein  YP_003307717  unclonable  1.07954e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0919  CDS  NC_013517  970596  971054  459  hypothetical protein  YP_003307718  unclonable  9.27385e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0920  CDS  NC_013517  971428  972099  672  hypothetical protein  YP_003307719  unclonable  1.62179e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_0978  CDS  NC_013517  1041190  1041903  714  transcriptional regulator, GntR family  YP_003307777  unclonable  6.22691e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1108  CDS  NC_013517  1214404  1215450  1047  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  YP_003307907  unclonable  9.71871e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1109  CDS  NC_013517  1215749  1216234  486  hypothetical protein  YP_003307908  unclonable  8.2959e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1110  CDS  NC_013517  1216305  1216943  639  hypothetical protein  YP_003307909  unclonable  1.4203e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1120  CDS  NC_013517  1226274  1227866  1593  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003307919  unclonable  3.41148e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1121  CDS  NC_013517  1228060  1228539  480  hypothetical protein  YP_003307920  unclonable  3.57379e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1157  CDS  NC_013517  1261317  1261844  528  hypothetical protein  YP_003307956  unclonable  1.19479e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1158  CDS  NC_013517  1261923  1262885  963  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003307957  unclonable  5.97249e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1159  CDS  NC_013517  1263081  1263755  675  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  YP_003307958  unclonable  2.55894e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1160  CDS  NC_013517  1263796  1264590  795  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_003307959  unclonable  5.79456e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1186  CDS  NC_013517  1288953  1291118  2166  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_003307985  unclonable  4.00543e-08  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1229  CDS  NC_013517  1338053  1338766  714  hypothetical protein  YP_003308028  unclonable  2.00658e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1290  CDS  NC_013517  1389359  1389877  519  transcriptional regulator, MarR family  YP_003308087  unclonable  1.03671e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1291  CDS  NC_013517  1390008  1390313  306  hypothetical protein  YP_003308088  unclonable  3.23141e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1292  CDS  NC_013517  1390643  1392613  1971  beta-lactamase domain protein  YP_003308089  unclonable  1.52038e-08  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1293  CDS  NC_013517  1392792  1392929  138  hypothetical protein  YP_003308090  unclonable  1.41752e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1294  CDS  NC_013517  1393175  1393357  183  hypothetical protein  YP_003308091  unclonable  2.09611e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1295  CDS  NC_013517  1394048  1394290  243  hypothetical protein  YP_003308092  unclonable  2.25022e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1296  CDS  NC_013517  1394314  1394967  654  protein of unknown function DUF421  YP_003308093  unclonable  1.43526e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1297  CDS  NC_013517  1394977  1395423  447  hypothetical protein  YP_003308094  unclonable  6.84072e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1315  CDS  NC_013517  1411179  1411610  432  hypothetical protein  YP_003308112  unclonable  6.17647e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1316  CDS  NC_013517  1411651  1412295  645  hypothetical protein  YP_003308113  unclonable  1.32332e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1317  CDS  NC_013517  1412314  1412721  408  TPR repeat-containing protein  YP_003308114  unclonable  4.69709e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1318  CDS  NC_013517  1412702  1414306  1605  TPR repeat-containing protein  YP_003308115  unclonable  6.93072e-09  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1319  CDS  NC_013517  1414401  1414565  165  hypothetical protein  YP_003308116  unclonable  1.82184e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1320  CDS  NC_013517  1414610  1414987  378  hypothetical protein  YP_003308117  unclonable  3.91219e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1321  CDS  NC_013517  1416136  1416681  546  TPR repeat-containing protein  YP_003308118  unclonable  4.64925e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1371  CDS  NC_013517  1453450  1454214  765  putative esterase  YP_003308166  unclonable  1.25757e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1502  CDS  NC_013517  1589446  1589664  219  hypothetical protein  YP_003308293  unclonable  3.87236e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1517  CDS  NC_013517  1605666  1606049  384  rare lipoprotein A  YP_003308307  unclonable  5.81263e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1538  CDS  NC_013517  1637184  1638086  903  hypothetical protein  YP_003308328  unclonable  5.40016e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1558  CDS  NC_013517  1661262  1661537  276  histone family protein DNA-binding protein  YP_003308348  unclonable  7.49747e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1582  CDS  NC_013517  1680472  1681056  585  transcriptional regulator, TetR family  YP_003308372  unclonable  3.13158e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1759  CDS  NC_013517  1893138  1893641  504  hypothetical protein  YP_003308548  unclonable  1.67239e-10  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1760  CDS  NC_013517  1893825  1894268  444  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003308549  unclonable  7.9668e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Sterm_1771  CDS  NC_013517  1901536  1902192  657  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_003308560  unclonable  6.50244e-11  n/a    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>