78 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Apre_0015  CDS  NC_013171  17737  19923  2187  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003151791  unclonable  9.73096e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0016  CDS  NC_013171  20264  21226  963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003151792  unclonable  4.61837e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0083  CDS  NC_013171  104092  105606  1515  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  YP_003151857  unclonable  6.36511e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0121  CDS  NC_013171  143787  145136  1350  potassium uptake protein, TrkH family  YP_003151894  unclonable  2.17077e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0262  CDS  NC_013171  294447  295712  1266  uracil transporter  YP_003152035  unclonable  1.45951e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0295  CDS  NC_013171  329004  330137  1134  basic membrane lipoprotein  YP_003152067  unclonable  1.88211e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0296  CDS  NC_013171  330256  331788  1533  ABC transporter related  YP_003152068  unclonable  6.7661e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0320  CDS  NC_013171  360580  361263  684  AzlC family protein  YP_003152092  unclonable  2.18958e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0321  CDS  NC_013171  361383  362756  1374  hypothetical protein  YP_003152093  unclonable  2.14801e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0322  CDS  NC_013171  362756  363580  825  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  YP_003152094  unclonable  3.37661e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0323  CDS  NC_013171  364595  365863  1269  hypothetical protein  YP_003152095  unclonable  1.75392e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0453  CDS  NC_013171  516223  517812  1590  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  YP_003152221  unclonable  8.81865e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0454  CDS  NC_013171  517859  519187  1329  glycoside hydrolase family 4  YP_003152222  unclonable  2.62925e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0455  CDS  NC_013171  519343  519978  636  putative transcriptional regulator, RpiR family  YP_003152223  unclonable  1.71967e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0456  CDS  NC_013171  519956  520705  750  transcriptional regulator, RpiR family  YP_003152224  unclonable  2.84572e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0457  CDS  NC_013171  521030  521437  408  ribosomal protein S12  YP_003152225  unclonable  9.30962e-11  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0486  CDS  NC_013171  555188  557152  1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_003152254  unclonable  2.46606e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0561  CDS  NC_013171  660445  662538  2094  copper-translocating P-type ATPase  YP_003152328  unclonable  7.8607e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0573  CDS  NC_013171  672062  673366  1305  Citrate transporter  YP_003152338  unclonable  1.30469e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0605  CDS  NC_013171  704718  706172  1455  carbon starvation protein CstA  YP_003152368  unclonable  1.90307e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0606  CDS  NC_013171  706406  706849  444  protein of unknown function DUF150  YP_003152369  unclonable  6.62285e-11  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0634  CDS  NC_013171  732082  733143  1062  periplasmic binding protein  YP_003152394  unclonable  1.0772e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0670  CDS  NC_013171  766374  766562  189  ribosomal protein L28  YP_003152430  unclonable  4.25645e-11  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0701  CDS  NC_013171  800600  801541  942  periplasmic solute binding protein  YP_003152456  unclonable  7.05514e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0813  CDS  NC_013171  905085  905462  378  endodeoxyribonuclease RusA  YP_003152562  unclonable  4.38837e-11  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0885  CDS  NC_013171  958630  959472  843  protein of unknown function DUF161  YP_003152634  unclonable  4.34482e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0925  CDS  NC_013171  993932  995095  1164  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  YP_003152674  unclonable  1.71827e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0926  CDS  NC_013171  995191  995499  309  ribosomal protein L21  YP_003152675  unclonable  5.98947e-11  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_0985  CDS  NC_013171  1055404  1056735  1332  domain of unknown function DUF1727  YP_003152734  unclonable  2.65712e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1042  CDS  NC_013171  1111443  1114970  3528  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003152791  unclonable  5.72924e-06  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1064  CDS  NC_013171  1139652  1140857  1206  sodium:dicarboxylate symporter  YP_003152812  unclonable  1.88211e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1125  CDS  NC_013171  1210698  1211498  801  PSP1 domain protein  YP_003152872  unclonable  7.05514e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1126  CDS  NC_013171  1211499  1212284  786  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  YP_003152873  unclonable  6.50925e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1127  CDS  NC_013171  1212281  1212610  330  protein of unknown function DUF970  YP_003152874  unclonable  1.58497e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1128  CDS  NC_013171  1212607  1213236  630  thymidylate kinase  YP_003152875  unclonable  3.77122e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1129  CDS  NC_013171  1213325  1213978  654  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  YP_003152876  unclonable  4.8094e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1130  CDS  NC_013171  1214105  1214614  510  Redoxin domain protein  YP_003152877  unclonable  2.3732e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1131  CDS  NC_013171  1214661  1215443  783  tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase  YP_003152878  unclonable  6.2507e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1132  CDS  NC_013171  1215503  1217173  1671  NLP/P60 protein  YP_003152879  unclonable  1.55845e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1138  CDS  NC_013171  1223817  1224443  627  hypothetical protein  YP_003152885  unclonable  1.96047e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1146  CDS  NC_013171  1231604  1232314  711  ribosomal protein L1  YP_003152893  unclonable  2.84572e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1188  CDS  NC_013171  1267607  1269346  1740  ABC transporter related  YP_003152934  unclonable  1.2355e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1196  CDS  NC_013171  1274826  1275419  594  SNARE associated Golgi protein  YP_003152941  unclonable  1.86388e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1225  CDS  NC_013171  1308013  1309269  1257  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  YP_003152970  unclonable  3.0938e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1226  CDS  NC_013171  1309274  1310353  1080  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003152971  unclonable  1.35939e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1227  CDS  NC_013171  1310346  1311155  810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003152972  unclonable  3.77122e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1228  CDS  NC_013171  1311155  1311946  792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003152973  unclonable  4.9585e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1229  CDS  NC_013171  1311939  1313051  1113  ABC transporter related  YP_003152974  unclonable  1.35939e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1230  CDS  NC_013171  1313262  1314455  1194  sodium:dicarboxylate symporter  YP_003152975  unclonable  1.70025e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1245  CDS  NC_013171  1331176  1332480  1305  sodium:neurotransmitter symporter  YP_003152990  unclonable  5.15099e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1262  CDS  NC_013171  1354387  1354869  483  hypothetical protein  YP_003153007  unclonable  5.05046e-11  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1263  CDS  NC_013171  1354936  1355637  702  hypothetical protein  YP_003153008  unclonable  1.70167e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1275  CDS  NC_013171  1370285  1371718  1434  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_003153019  unclonable  1.50477e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1293  CDS  NC_013171  1390298  1391140  843  GTP-binding protein HSR1-related  YP_003153037  unclonable  2.7879e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1305  CDS  NC_013171  1398086  1398409  324  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  YP_003153049  unclonable  1.61782e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1321  CDS  NC_013171  1413450  1413842  393  protein of unknown function DUF1312  YP_003153065  unclonable  1.02941e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1356  CDS  NC_013171  1457243  1458382  1140  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003153100  unclonable  1.00384e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1357  CDS  NC_013171  1458902  1460326  1425  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  YP_003153101  unclonable  3.25772e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1367  CDS  NC_013171  1470966  1471409  444  transcriptional regulator, MarR family  YP_003153111  unclonable  1.23372e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1368  CDS  NC_013171  1471512  1472417  906  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  YP_003153112  unclonable  5.2679e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1370  CDS  NC_013171  1474237  1475775  1539  integral membrane protein MviN  YP_003153114  unclonable  4.11577e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1379  CDS  NC_013171  1483240  1484223  984  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  YP_003153123  unclonable  7.88807e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1380  CDS  NC_013171  1484364  1485359  996  PfkB domain protein  YP_003153124  unclonable  8.7223e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1381  CDS  NC_013171  1485460  1486761  1302  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  YP_003153125  unclonable  2.4748e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1395  CDS  NC_013171  1495599  1496039  441  ribosomal protein L13  YP_003153139  unclonable  1.19663e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1396  CDS  NC_013171  1496231  1497388  1158  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  YP_003153140  unclonable  1.55309e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1397  CDS  NC_013171  1497395  1498192  798  phosphomethylpyrimidine kinase  YP_003153141  unclonable  3.85147e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1398  CDS  NC_013171  1499308  1500765  1458  cation transporter  YP_003153142  unclonable  2.71372e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1399  CDS  NC_013171  1500768  1502135  1368  TrkA-N domain protein  YP_003153143  unclonable  2.00171e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1400  CDS  NC_013171  1502448  1503980  1533  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_003153144  unclonable  5.09696e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1509  CDS  NC_013171  1643819  1644661  843  dimethyladenosine transferase  YP_003153251  unclonable  4.52453e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1514  CDS  NC_013171  1649701  1650951  1251  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_003153256  unclonable  1.30469e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1532  CDS  NC_013171  1667173  1668738  1566  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_003153274  unclonable  7.42364e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1576  CDS  NC_013171  1697278  1698756  1479  protein of unknown function DUF344  YP_003153318  unclonable  3.6062e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1577  CDS  NC_013171  1698794  1699570  777  protein of unknown function DUF1113  YP_003153319  unclonable  2.70408e-10  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1578  CDS  NC_013171  1700217  1701521  1305  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_003153320  unclonable  3.32533e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1666    NC_013171  1808046  1809469  1424      unclonable  4.20349e-09  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Apre_1734  CDS  NC_013171  1878518  1880212  1695  Na/Pi-cotransporter II-related protein  YP_003153473  unclonable  1.08248e-08  n/a    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>