32 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tter_1895  CDS  NC_013526  14443  17277  +  2835  CRISPR-associated helicase Cas3  YP_003323623  unclonable  0.0000000246489  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_1919  CDS  NC_013526  39299  40057  +  759  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003323647  unclonable  0.00000000000354716  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_1920  CDS  NC_013526  40013  41704  -  1692  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  YP_003323648  unclonable  0.000000000199537  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2030  CDS  NC_013526  155162  156628  -  1467  peptidase S26B, signal peptidase  YP_003323756  unclonable  0.0000000000643022  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2031  CDS  NC_013526  156644  157039  -  396  hypothetical protein  YP_003323757  unclonable  0.000000000000757072  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2032  CDS  NC_013526  157282  157572  +  291  hypothetical protein  YP_003323758  unclonable  0.000000000000353816  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2064  CDS  NC_013526  194790  196097  -  1308  hypothetical protein  YP_003323789  unclonable  0.000000000070482  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2065  CDS  NC_013526  196609  197664  +  1056  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_003323790  unclonable  0.000000000037262  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2101  CDS  NC_013526  231296  233212  +  1917  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  YP_003323825  unclonable  0.000000000444895  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2145  CDS  NC_013526  288491  291304  +  2814  protein of unknown function DUF1156  YP_003323868  unclonable  0.0000000164543  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2258  CDS  NC_013526  406126  406266  +  141  hypothetical protein  YP_003323979  unclonable  0.000000000000925005  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2259  CDS  NC_013526  406268  406516  +  249  hypothetical protein  YP_003323980  unclonable  0.00000000000135355  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2260  CDS  NC_013526  406861  407853  +  993  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  YP_003323981  unclonable  0.0000000000313707  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2326  CDS  NC_013526  480066  481070  +  1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  YP_003324047  unclonable  0.0000000000119117  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2396  CDS  NC_013526  542144  542971  -  828  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  YP_003324114  unclonable  0.00000000000818527  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2397  CDS  NC_013526  543063  543407  +  345  protein of unknown function DUF488  YP_003324115  unclonable  0.00000000000131309  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2398  CDS  NC_013526  543413  544315  +  903  ABC transporter related protein  YP_003324116  unclonable  0.0000000000133291  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2399  CDS  NC_013526  544312  545037  +  726  ABC-2 type transporter  YP_003324117  unclonable  0.00000000000992199  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2400  CDS  NC_013526  545084  545275  +  192  hypothetical protein  YP_003324118  unclonable  0.00000000000182897  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2401  CDS  NC_013526  545505  545672  -  168  hypothetical protein  YP_003324119  unclonable  0.00000000000143773  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2402  CDS  NC_013526  545744  546907  -  1164  glycoside hydrolase family 76  YP_003324120  unclonable  0.0000000000669737  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2475  CDS  NC_013526  631557  632579  +  1023  transcriptional regulator, LacI family  YP_003324190  unclonable  0.0000000000232076  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2609  CDS  NC_013526  784483  785394  -  912  ABC transporter related protein  YP_003324319  unclonable  0.0000000000416385  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2610  CDS  NC_013526  785475  786908  -  1434  sulfatase  YP_003324320  unclonable  0.000000000218719  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2611  CDS  NC_013526  787037  787519  +  483  transcriptional regulator, MarR family  YP_003324321  unclonable  0.0000000000027069  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2612  CDS  NC_013526  787537  789234  +  1698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_003324322  unclonable  0.000000000331464  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2664  CDS  NC_013526  850141  853068  +  2928  hypothetical protein  YP_003324374  unclonable  0.0000000490986  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2704  CDS  NC_013526  895962  897155  +  1194  RNA methyltransferase, TrmA family  YP_003324414  unclonable  0.0000000000380281  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2705  CDS  NC_013526  897204  897764  +  561  protein of unknown function DUF955  YP_003324415  unclonable  0.00000000000214852  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2706  CDS  NC_013526  897769  898038  -  270  hypothetical protein  YP_003324416  unclonable  0.000000000000644914  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2707  CDS  NC_013526  898258  899529  +  1272  hypothetical protein  YP_003324417  unclonable  0.000000000039594  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Tter_2708  CDS  NC_013526  899539  902334  -  2796  alpha-L-rhamnosidase  YP_003324418  unclonable  0.0000000130197  n/a    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>