43 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dbac_0014  CDS  NC_013173  29597  29758  162  hypothetical protein  YP_003156560  unclonable  2.00541e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0015  CDS  NC_013173  30060  30398  339  hypothetical protein  YP_003156561  unclonable  3.51673e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0053  CDS  NC_013173  75146  77560  2415  ATP-dependent protease La  YP_003156599  unclonable  9.30171e-07  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0054  CDS  NC_013173  77688  78368  681  DNA repair protein RadC  YP_003156600  unclonable  1.85738e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0301  CDS  NC_013173  354799  355776  978  carbonic anhydrase  YP_003156844  unclonable  4.71687e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0302  CDS  NC_013173  356000  356818  819  hypothetical protein  YP_003156845  unclonable  2.56002e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0310  CDS  NC_013173  363236  364555  1320  hypothetical protein  YP_003156853  unclonable  1.63597e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0452  CDS  NC_013173  529157  530209  1053  RelA/SpoT domain protein  YP_003156993  unclonable  5.76608e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0513  CDS  NC_013173  594171  594563  393  transcriptional regulator, MucR family  YP_003157053  unclonable  4.75378e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0589  CDS  NC_013173  662072  662611  540  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_003157129  unclonable  3.03526e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0590  CDS  NC_013173  662780  662923  144  hypothetical protein  YP_003157130  unclonable  6.61607e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0591  CDS  NC_013173  662910  665006  2097  glucosyltransferase MdoH  YP_003157131  unclonable  3.96207e-07  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0592  CDS  NC_013173  665124  665618  495  hypothetical protein  YP_003157132  unclonable  1.48932e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0633  CDS  NC_013173  707431  708027  597  OmpA/MotB domain protein  YP_003157172  unclonable  1.32054e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0634  CDS  NC_013173  708027  708467  441  hypothetical protein  YP_003157173  unclonable  8.00273e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0677  CDS  NC_013173  751290  752537  1248  transcription termination factor Rho  YP_003157216  unclonable  2.84119e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0886  CDS  NC_013173  968472  968729  258  hypothetical protein  YP_003157419  unclonable  5.15114e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_0887  CDS  NC_013173  969445  970143  699  hypothetical protein  YP_003157420  unclonable  2.3856e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_1044  CDS  NC_013173  1134950  1138597  3648  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003157573  unclonable  0.000118748  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_1588  CDS  NC_013173  1804308  1805315  1008  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  YP_003158097  unclonable  4.66861e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_1814  CDS  NC_013173  2068854  2069984  1131  OmpA/MotB domain protein  YP_003158321  unclonable  1.02046e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2231  CDS  NC_013173  2572577  2573368  792  protein of unknown function DUF1555  YP_003158729  unclonable  4.71687e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2256  CDS  NC_013173  2598091  2600904  2814  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  YP_003158754  unclonable  2.77534e-06  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2257  CDS  NC_013173  2601102  2601350  249  prevent-host-death family protein  YP_003158755  unclonable  3.44614e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2258  CDS  NC_013173  2601340  2601627  288  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_003158756  unclonable  4.47442e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2259  CDS  NC_013173  2601781  2601969  189  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  YP_003158757  unclonable  3.34335e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2260  CDS  NC_013173  2602293  2602874  582  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003158758  unclonable  1.6305e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2291  CDS  NC_013173  2629899  2630390  492  putative nucleotide-binding protein  YP_003158788  unclonable  4.70515e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2292  CDS  NC_013173  2630693  2631097  405  transcriptional regulator, MucR family  YP_003158789  unclonable  3.55308e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2354  CDS  NC_013173  2708924  2709901  978  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  YP_003158850  unclonable  5.06174e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2364  CDS  NC_013173  2720545  2720814  270  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_003158860  unclonable  4.00721e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2593  CDS  NC_013173  2954050  2954580  531  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_003159086  unclonable  1.55055e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2764  CDS  NC_013173  3146909  3147277  369  ribosomal protein L14  YP_003159256  unclonable  8.16669e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2799  CDS  NC_013173  3178479  3179786  1308  outer membrane efflux protein  YP_003159291  unclonable  1.94078e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2800  CDS  NC_013173  3179970  3180068  99  hypothetical protein  YP_003159292  unclonable  2.40159e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_2963  CDS  NC_013173  3351383  3353164  1782  30S ribosomal protein S1  YP_003159454  unclonable  1.74303e-07  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3036  CDS  NC_013173  3434349  3434879  531  hypothetical protein  YP_003159527  unclonable  1.1477e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3145  CDS  NC_013173  3559069  3560376  1308  hypothetical protein  YP_003159636  unclonable  2.46792e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3146  CDS  NC_013173  3560539  3561264  726  regulatory protein GntR HTH  YP_003159637  unclonable  2.3856e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3196  CDS  NC_013173  3619190  3620458  1269  sulfate adenylyltransferase  YP_003159687  unclonable  3.04807e-08  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_3197  CDS  NC_013173  3620669  3621157  489  adenylylsulfate reductase, beta subunit  YP_003159688  unclonable  3.12858e-09  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_R0059  tRNA  NC_013173  3180078  3180154  77  tRNA-Arg    unclonable  2.45079e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Dbac_R0060  tRNA  NC_013173  3180313  3180388  76  tRNA-Phe    unclonable  3.08543e-10  n/a    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>