27 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aaci_0209  CDS  NC_013205  224143  225630  1488  lysyl-tRNA synthetase  YP_003183661  unclonable  1.64497e-07  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0379  CDS  NC_013205  432196  432483  288  chaperonin Cpn10  YP_003183827  unclonable  9.45621e-09  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0472  CDS  NC_013205  537933  538172  240  transcriptional regulator, XRE family  YP_003183919  unclonable  9.1739e-09  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0473  CDS  NC_013205  538156  538326  171  hypothetical protein  YP_003183920  unclonable  6.86024e-09  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0474  CDS  NC_013205  538316  538432  117  hypothetical protein  YP_003183921  unclonable  5.28795e-09  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0475  CDS  NC_013205  538429  538671  243  hypothetical protein  YP_003183922  unclonable  7.2142e-09  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0558  CDS  NC_013205  610786  612012  1227  hypothetical protein  YP_003183996  unclonable  6.67131e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0678  CDS  NC_013205  724969  725487  519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003184114  unclonable  1.1557e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_0679  CDS  NC_013205  725836  726636  801  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  YP_003184115  unclonable  2.47428e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1355  CDS  NC_013205  1407183  1407716  534  16S rRNA processing protein RimM  YP_003184771  unclonable  1.16768e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1356  CDS  NC_013205  1407718  1408491  774  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  YP_003184772  unclonable  2.65451e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1472  CDS  NC_013205  1526231  1527856  1626  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003184886  unclonable  4.40496e-07  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1473  CDS  NC_013205  1528087  1529154  1068  recA protein  YP_003184887  unclonable  1.12388e-07  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_1500  CDS  NC_013205  1555842  1556564  723  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_003184913  unclonable  1.53009e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2258  CDS  NC_013205  2316679  2318454  1776  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003185656  unclonable  7.52385e-07  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2491  CDS  NC_013205  2560807  2562588  1782  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003185886  unclonable  1.17082e-06  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2736  CDS  NC_013205  2800781  2801872  1092  PilT protein domain protein  YP_003186129  unclonable  8.48618e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2844  CDS  NC_013205  2903421  2904488  1068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  YP_003186237  unclonable  4.16569e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2845  CDS  NC_013205  2904672  2905460  789  ABC transporter related  YP_003186238  unclonable  3.05436e-08  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2952  CDS  NC_013206  1132  1836  705  hypothetical protein  YP_003186344  unclonable  6.89868e-12  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2953  CDS  NC_013206  1850  3037  1188  hypothetical protein  YP_003186345  unclonable  8.32584e-11  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2954  CDS  NC_013206  3420  4091  672  transcriptional regulator, XRE family  YP_003186346  unclonable  4.01895e-12  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2987  CDS  NC_013206  29171  30403  1233  phosphoribosylglycinamide synthetase  YP_003186379  unclonable  8.75543e-11  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_2988  CDS  NC_013206  30497  31678  1182  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003186380  unclonable  3.35031e-11  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_R0027  rRNA  NC_013205  296003  297528  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  2.50907e-07  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_R0034  tRNA  NC_013205  725661  725736  76  tRNA-Pro    unclonable  2.21471e-09  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_R0049  rRNA  NC_013205  1408837  1410362  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  2.50907e-07  n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>