21 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Coch_0061  CDS  NC_013162  80011  81627  1617  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  YP_003140187  unclonable  3.29642e-07  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0296  CDS  NC_013162  376985  377365  381  hypothetical protein  YP_003140420  unclonable  2.78969e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0297  CDS  NC_013162  377380  377571  192  YcfA family protein  YP_003140421  unclonable  1.57484e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0298  CDS  NC_013162  377677  379959  2283  alpha-1,2-mannosidase  YP_003140422  unclonable  9.77732e-07  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0422  CDS  NC_013162  532845  533282  438  50S ribosomal protein L11  YP_003140546  unclonable  9.57396e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0500  CDS  NC_013162  637551  638144  594  hypothetical protein  YP_003140624  unclonable  1.00693e-08  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0758  CDS  NC_013162  916684  917907  1224  hypothetical protein  YP_003140876  unclonable  8.41895e-08  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0870  CDS  NC_013162  1030080  1030472  393  hypothetical protein  YP_003140986  unclonable  4.21104e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0871  CDS  NC_013162  1030657  1030869  213  hypothetical protein  YP_003140987  unclonable  3.1798e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0924  CDS  NC_013162  1074383  1074478  96  hypothetical protein  YP_003141040  unclonable  2.00379e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0925  CDS  NC_013162  1074475  1074852  378  hypothetical protein  YP_003141041  unclonable  5.24962e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_0941  CDS  NC_013162  1095063  1096439  1377  hypothetical protein  YP_003141057  unclonable  8.94355e-08  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1154  CDS  NC_013162  1375174  1375593  420  50S ribosomal protein L16  YP_003141268  unclonable  3.2781e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1155  CDS  NC_013162  1375604  1375795  192  50S ribosomal protein L29  YP_003141269  unclonable  1.43802e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1156  CDS  NC_013162  1375810  1376067  258  30S ribosomal protein S17  YP_003141270  unclonable  1.88626e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1157  CDS  NC_013162  1376070  1376438  369  50S ribosomal protein L14  YP_003141271  unclonable  2.42417e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1222  CDS  NC_013162  1430124  1430285  162  hypothetical protein  YP_003141333  unclonable  1.55848e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1223  CDS  NC_013162  1430305  1432077  1773  signal peptide peptidase SppA, 67K type  YP_003141334  unclonable  3.75913e-07  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_1771  CDS  NC_013162  2110528  2111181  654  hypothetical protein  YP_003141877  unclonable  1.47308e-08  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_2118  CDS  NC_013162  2538771  2539385  615  hypothetical protein  YP_003142223  unclonable  5.30474e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Coch_2119  CDS  NC_013162  2539406  2539882  477  hypothetical protein  YP_003142224  unclonable  3.11545e-09  n/a    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>