23 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rmar_0305  CDS  NC_013501  332933  333886  954  PKD domain containing protein  YP_003289598  unclonable  7.57155e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0404  CDS  NC_013501  447868  448830  963  integrase family protein  YP_003289696  unclonable  8.63146e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0686  CDS  NC_013501  786311  787264  954  transcriptional regulator, DeoR family  YP_003289972  unclonable  7.19741e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0687  CDS  NC_013501  787456  790656  3201  TonB-dependent receptor plug  YP_003289973  unclonable  3.68549e-05  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0746  CDS  NC_013501  869751  870236  486  single-strand binding protein  YP_003290032  unclonable  5.49741e-09  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1069  CDS  NC_013501  1224112  1227105  2994  glycoside hydrolase family 10  YP_003290349  unclonable  3.26536e-05  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1101  CDS  NC_013501  1272860  1274056  1197  translation elongation factor Tu  YP_003290380  unclonable  1.13146e-07  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1386  CDS  NC_013501  1617063  1619963  2901  hypothetical protein  YP_003290663  unclonable  3.13408e-05  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1387  CDS  NC_013501  1620163  1621890  1728  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003290664  unclonable  8.30538e-07  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1388  CDS  NC_013501  1621975  1623648  1674  mercuric reductase  YP_003290665  unclonable  4.33137e-07  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1484  CDS  NC_013501  1734105  1734989  885  hypothetical protein  YP_003290759  unclonable  2.95365e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1485  CDS  NC_013501  1735158  1735619  462  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003290760  unclonable  8.36968e-09  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1756  CDS  NC_013501  2046446  2047480  1035  hypothetical protein  YP_003291028  unclonable  6.6418e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_1916  CDS  NC_013501  2236283  2236924  642  hypothetical protein  YP_003291187  unclonable  1.51039e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2307  CDS  NC_013501  2671698  2672312  615  YceI family protein  YP_003291574  unclonable  1.52609e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2308  CDS  NC_013501  2672465  2673793  1329  FolC bifunctional protein  YP_003291575  unclonable  9.1683e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2525  CDS  NC_013501  2935428  2936618  1191  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_003291789  unclonable  7.96245e-08  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2842  CDS  NC_013502  46430  47140  711  hypothetical protein  YP_003292097  unclonable  2.3578e-06  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2843  CDS  NC_013502  47137  47619  483  hypothetical protein  YP_003292098  unclonable  1.64273e-06  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_2844  CDS  NC_013502  47622  48221  600  protein of unknown function DUF1130  YP_003292099  unclonable  2.71396e-06  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_R0023  tRNA  NC_013501  1272522  1272608  87  tRNA-Tyr    unclonable  4.32297e-09  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_R0024  tRNA  NC_013501  1272616  1272691  76  tRNA-Gly    unclonable  3.90894e-09  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_R0025  tRNA  NC_013501  1272701  1272775  75  tRNA-Thr    unclonable  4.11074e-09  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>