20 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mrub_0180  CDS  NC_013946  160030  160332  303  histone family protein DNA-binding protein  YP_003505980  unclonable  4.56063e-10  normal  0.670354  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0181  CDS  NC_013946  160572  161015  444  hypothetical protein  YP_003505981  unclonable  7.52164e-10  normal  0.677539  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_0905  CDS  NC_013946  891344  892231  888  response regulator receiver protein  YP_003506690  unclonable  2.45258e-09  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1384  CDS  NC_013946  1420898  1421098  201  50S ribosomal protein L35  YP_003507166  unclonable  7.68354e-11  normal  0.0909264  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1385  CDS  NC_013946  1421115  1421462  348  50S ribosomal protein L20  YP_003507167  unclonable  1.2054e-10  normal  0.0978836  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1535  CDS  NC_013946  1571697  1571981  285  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  YP_003507317  unclonable  2.24149e-10  normal  0.214474  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1641  CDS  NC_013946  1672219  1673217  999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_003507422  unclonable  4.38606e-09  normal  0.466828  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1779  CDS  NC_013946  1832329  1833432  1104  FAD dependent oxidoreductase  YP_003507559  unclonable  5.10083e-09  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1804  CDS  NC_013946  1856205  1856879  675  peptidase membrane zinc metallopeptidase putative  YP_003507584  unclonable  8.40168e-10  normal  0.357592  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_1932  CDS  NC_013946  1988669  1989847  1179  NusA antitermination factor  YP_003507709  unclonable  1.67668e-09  decreased coverage  7.52271e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2015  CDS  NC_013946  2053963  2054949  987  extracellular solute-binding protein family 1  YP_003507791  unclonable  2.68441e-09  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2249  CDS  NC_013946  2299782  2302229  2448  ATP-dependent protease La  YP_003508022  unclonable  2.34366e-07  normal  0.137049  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2250  CDS  NC_013946  2302369  2303367  999  hypothetical protein  YP_003508023  unclonable  1.29239e-09  normal  0.0239779  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2278    NC_013946  2329236  2331110  1875      unclonable  2.77608e-08  unclonable  8.85534e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2524  CDS  NC_013946  2571044  2571784  741  single-strand binding protein  YP_003508295  unclonable  8.23265e-10  normal  0.0673427  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2649  CDS  NC_013946  2688501  2689661  1161  Extracellular ligand-binding receptor  YP_003508419  unclonable  2.93817e-09  normal  0.0179491  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2650  CDS  NC_013946  2689954  2690097  144  hypothetical protein  YP_003508420  unclonable  6.10287e-11  normal  0.0124373  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2651  CDS  NC_013946  2690107  2691087  981  inner-membrane translocator  YP_003508421  unclonable  8.92409e-10  hitchhiker  0.00872106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_2990  CDS  NC_013946  3025821  3028619  2799  S-layer domain-containing protein  YP_003508754  unclonable  1.40027e-06  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Mrub_R0006  tRNA  NC_013946  377362  377438  77  tRNA-Met    unclonable  5.68844e-11  normal  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>